118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_0947 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  90.63 
 
 		 491 aa  929    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  74.47 
 
 		 481 aa  759    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  98.37 
 
 		 491 aa  1000    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  100 
 
 		 491 aa  1017    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  83.9 
 
 		 481 aa  832    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  83.86 
 
 		 481 aa  833    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  83.9 
 
 		 481 aa  835    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  66.38 
 
 		 477 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  84.32 
 
 		 481 aa  828    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  50.98 
 
 		 473 aa  491  1e-137  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.75 
 
 		 487 aa  423  1e-117  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.42 
 
 		 491 aa  412  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  46.57 
 
 		 487 aa  410  1e-113  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.22 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.4 
 
 		 471 aa  399  9.999999999999999e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.53 
 
 		 497 aa  356  5e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.04 
 
 		 486 aa  293  4e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  53.27 
 
 		 197 aa  221  1.9999999999999999e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  55.17 
 
 		 216 aa  206  1e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  54.6 
 
 		 221 aa  205  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  54.6 
 
 		 221 aa  205  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  55.17 
 
 		 221 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  54.02 
 
 		 221 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  54.02 
 
 		 221 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  54.02 
 
 		 221 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  54.02 
 
 		 221 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  54.02 
 
 		 221 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  53.45 
 
 		 221 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  53.45 
 
 		 221 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  47.29 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  47.29 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  46.8 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  44.09 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  46.8 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  47.29 
 
 		 455 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  46.31 
 
 		 455 aa  186  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  46.73 
 
 		 455 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  47.37 
 
 		 458 aa  184  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  45.81 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  48.19 
 
 		 456 aa  183  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  45.81 
 
 		 455 aa  183  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  46.49 
 
 		 201 aa  181  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  47.15 
 
 		 456 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  45.85 
 
 		 455 aa  179  7e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  42.71 
 
 		 201 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  46.63 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  46.99 
 
 		 458 aa  173  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  46.39 
 
 		 445 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  44.61 
 
 		 220 aa  159  9e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  40.74 
 
 		 197 aa  156  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  36.73 
 
 		 236 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  30.1 
 
 		 388 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  31.6 
 
 		 389 aa  125  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  29.63 
 
 		 390 aa  124  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  37.76 
 
 		 465 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  36.73 
 
 		 464 aa  114  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  29.02 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  32.09 
 
 		 214 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 214 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  32.09 
 
 		 214 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  33.79 
 
 		 233 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  32.09 
 
 		 214 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  35.5 
 
 		 171 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  32.21 
 
 		 214 aa  101  4e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  32.09 
 
 		 233 aa  101  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  38.01 
 
 		 172 aa  101  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  34.87 
 
 		 356 aa  100  5e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  34.55 
 
 		 192 aa  99  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 266 aa  97.8  4e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 244 aa  97.8  4e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  32.84 
 
 		 211 aa  97.4  5e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  34.65 
 
 		 266 aa  97.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 338 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  25.48 
 
 		 378 aa  94.7  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  34.33 
 
 		 651 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  34.64 
 
 		 262 aa  91.3  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  31.58 
 
 		 313 aa  89.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  33.33 
 
 		 183 aa  89.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  35.66 
 
 		 185 aa  88.6  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  32.95 
 
 		 251 aa  88.2  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 211 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  32.3 
 
 		 699 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  25.4 
 
 		 247 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  28.57 
 
 		 729 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  28.57 
 
 		 729 aa  70.1  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  26.73 
 
 		 307 aa  69.7  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  29.17 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  28.27 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  26.51 
 
 		 249 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  24.76 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  28.99 
 
 		 285 aa  65.1  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  30.3 
 
 		 359 aa  64.7  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  24.7 
 
 		 347 aa  64.3  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  25.26 
 
 		 405 aa  59.3  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  24.59 
 
 		 392 aa  59.7  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  30.19 
 
 		 727 aa  57  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  26.42 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  33.33 
 
 		 372 aa  56.2  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  27.06 
 
 		 235 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>