119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2206 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  100 
 
 
220 aa  451  1.0000000000000001e-126  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  56.88 
 
 
458 aa  243  1.9999999999999999e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  57.69 
 
 
456 aa  235  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  55.19 
 
 
459 aa  233  1.0000000000000001e-60  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  55.5 
 
 
456 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  53.18 
 
 
455 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  53.18 
 
 
455 aa  229  3e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  55.29 
 
 
455 aa  228  7e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  55.29 
 
 
455 aa  228  7e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  52.73 
 
 
455 aa  227  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  54.81 
 
 
455 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  53 
 
 
455 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  54.33 
 
 
455 aa  226  3e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  57.29 
 
 
458 aa  225  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  53.37 
 
 
455 aa  222  4e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  53.85 
 
 
455 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  53.85 
 
 
455 aa  222  4e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  51.85 
 
 
445 aa  206  3e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  46.5 
 
 
197 aa  180  1e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  45.07 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  45.07 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  44.55 
 
 
221 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  44.09 
 
 
221 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  44.09 
 
 
221 aa  170  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  44.09 
 
 
221 aa  170  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  44.09 
 
 
221 aa  170  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  46.26 
 
 
221 aa  169  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  44.09 
 
 
221 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  44.09 
 
 
221 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
216 aa  166  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.52 
 
 
491 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.44 
 
 
491 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.72 
 
 
477 aa  162  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.81 
 
 
481 aa  161  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.61 
 
 
491 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.86 
 
 
481 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.4 
 
 
481 aa  154  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.4 
 
 
481 aa  153  2e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.22 
 
 
481 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.08 
 
 
473 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.92 
 
 
486 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.33 
 
 
491 aa  143  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.09 
 
 
487 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.42 
 
 
497 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  37.21 
 
 
201 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.82 
 
 
471 aa  131  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  38.54 
 
 
197 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  37.31 
 
 
201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  44.81 
 
 
487 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.38 
 
 
485 aa  118  7e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.55 
 
 
465 aa  109  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  32.7 
 
 
356 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  35.87 
 
 
233 aa  101  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  34.63 
 
 
214 aa  100  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  36.54 
 
 
233 aa  100  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  36.54 
 
 
214 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  36.54 
 
 
214 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  36.54 
 
 
214 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  36.54 
 
 
214 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  41.43 
 
 
192 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.86 
 
 
464 aa  99.8  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  36.61 
 
 
185 aa  95.5  6e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  32.04 
 
 
245 aa  94.4  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  36.84 
 
 
236 aa  93.6  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  32.23 
 
 
338 aa  93.6  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  29.72 
 
 
262 aa  88.2  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  30.43 
 
 
244 aa  86.3  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  33.79 
 
 
211 aa  85.5  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  28.64 
 
 
266 aa  82  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  30.24 
 
 
171 aa  82  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  31.55 
 
 
313 aa  81.6  0.000000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  28.5 
 
 
266 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  29.76 
 
 
651 aa  79.3  0.00000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  28.34 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  30.1 
 
 
251 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  27.89 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  25.96 
 
 
400 aa  72.4  0.000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  30.63 
 
 
390 aa  69.7  0.00000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  29.45 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  29.06 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  29.11 
 
 
307 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  29.61 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  28.95 
 
 
378 aa  66.2  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  28.02 
 
 
443 aa  65.9  0.0000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  27.51 
 
 
438 aa  64.3  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  30.13 
 
 
534 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  30.13 
 
 
534 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  30.13 
 
 
534 aa  64.7  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  29.46 
 
 
391 aa  64.7  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  28.89 
 
 
347 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  26.44 
 
 
393 aa  64.7  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  26.12 
 
 
249 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  30.43 
 
 
389 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  26.7 
 
 
402 aa  63.5  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  32.77 
 
 
389 aa  62  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  29.71 
 
 
388 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  26.83 
 
 
247 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  34.95 
 
 
497 aa  61.2  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  28.04 
 
 
306 aa  61.2  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  28.38 
 
 
359 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>