195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1372 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 
393 aa  786    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  35.07 
 
 
307 aa  146  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  34.07 
 
 
285 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  37.76 
 
 
389 aa  133  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  38.54 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  36.36 
 
 
223 aa  131  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  37.68 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  37.75 
 
 
391 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  36.1 
 
 
378 aa  124  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  33.55 
 
 
389 aa  120  4.9999999999999996e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  35.71 
 
 
438 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  36.67 
 
 
235 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  35.14 
 
 
359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  33.9 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  32.43 
 
 
222 aa  114  4.0000000000000004e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  34.22 
 
 
368 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  36.8 
 
 
354 aa  110  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  36.41 
 
 
362 aa  107  5e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  36.04 
 
 
429 aa  106  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1493  Lysozyme  45.16 
 
 
481 aa  105  1e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.72016  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2735  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.6 
 
 
669 aa  105  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.637714 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  32.81 
 
 
351 aa  103  5e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  33.33 
 
 
372 aa  101  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  33.19 
 
 
347 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  26.35 
 
 
402 aa  100  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  36 
 
 
358 aa  99.8  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  36.1 
 
 
197 aa  99.8  8e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  35 
 
 
360 aa  98.2  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  28.9 
 
 
220 aa  96.7  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  30 
 
 
651 aa  90.9  3e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  25.56 
 
 
395 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  26.21 
 
 
392 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  32.89 
 
 
443 aa  90.1  5e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3091  5'-Nucleotidase domain protein  36 
 
 
1577 aa  87.4  4e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  31.46 
 
 
306 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2922  glycoside hydrolase family 18  43.33 
 
 
657 aa  84.7  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.183514  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2923  glycoside hydrolase family 18  44.35 
 
 
634 aa  83.2  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00791055  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3148  glycoside hydrolase family 18  41.51 
 
 
563 aa  82.8  0.000000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00268374  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  43.12 
 
 
623 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2924  PKD domain containing protein  44.74 
 
 
521 aa  82.8  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0135075  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  29.39 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  40.68 
 
 
453 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  40.68 
 
 
453 aa  79.7  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  40.68 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  40.68 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  40.68 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  40.68 
 
 
449 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  40.68 
 
 
453 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  31.25 
 
 
497 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2683  Endo-1,4-beta-xylanase  35.25 
 
 
1331 aa  79  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  28.77 
 
 
201 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  30.22 
 
 
201 aa  78.2  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  35.25 
 
 
1242 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1100  glycoside hydrolase family protein  34.06 
 
 
863 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.167101  normal  0.565849 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.11 
 
 
486 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  28.64 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  38.98 
 
 
504 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6134  glycoside hydrolase family 18  39.29 
 
 
675 aa  76.3  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040621 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  34.57 
 
 
212 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  38.22 
 
 
904 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.9 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  38.14 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.51 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  38.14 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  36.96 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  37.29 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.51 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  27.23 
 
 
456 aa  73.9  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  75 
 
 
1057 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  30.3 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  28.84 
 
 
221 aa  72.8  0.000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  28.84 
 
 
221 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  34.64 
 
 
455 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2805  glycosyl hydrolase family chitinase  34.11 
 
 
868 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2888  glycosyl hydrolase family chitinase  34.11 
 
 
868 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  27.65 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  34.44 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  27.65 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  27.65 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  37.29 
 
 
451 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  34.44 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  27.65 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  35.77 
 
 
455 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  36.44 
 
 
451 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  27.65 
 
 
221 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0218  glycoside hydrolase family 18  36.04 
 
 
586 aa  71.6  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  29.86 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  28.95 
 
 
455 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  27.65 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  27.65 
 
 
221 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  34.44 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  34.44 
 
 
455 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  35.59 
 
 
451 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2984  glycosyl hydrolase family chitinase  33.06 
 
 
868 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.87 
 
 
497 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  28.83 
 
 
338 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3083  glycoside hydrolase family 18  32.43 
 
 
867 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.204167  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3236  glycoside hydrolase family protein  32.43 
 
 
868 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  32.86 
 
 
276 aa  67  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  28.18 
 
 
455 aa  67  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>