255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2446 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 354 aa  717    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  54.58 
 
 		 438 aa  256  6e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  41.42 
 
 		 389 aa  244  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  41.84 
 
 		 359 aa  239  6.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  42.98 
 
 		 372 aa  237  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  39.12 
 
 		 347 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 360 aa  226  3e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  52.42 
 
 		 429 aa  215  7e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  52.81 
 
 		 443 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  39.82 
 
 		 358 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  46.61 
 
 		 400 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  47.89 
 
 		 306 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  37.45 
 
 		 307 aa  160  5e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  34.59 
 
 		 390 aa  145  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  38.14 
 
 		 391 aa  144  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  45.45 
 
 		 212 aa  136  5e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  36.53 
 
 		 378 aa  131  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  39.11 
 
 		 388 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  39.11 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  28.74 
 
 		 362 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  36.33 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  54 
 
 		 449 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  28.48 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  32.41 
 
 		 285 aa  108  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  49.17 
 
 		 437 aa  105  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  34.84 
 
 		 235 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  48.51 
 
 		 673 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  51.06 
 
 		 441 aa  100  3e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  46.32 
 
 		 460 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  30.67 
 
 		 222 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  51.06 
 
 		 477 aa  94  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  52.13 
 
 		 451 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  28.95 
 
 		 220 aa  92  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  33.91 
 
 		 497 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  51.76 
 
 		 593 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  52.38 
 
 		 448 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  31.42 
 
 		 223 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  31.84 
 
 		 395 aa  87  5e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  31.17 
 
 		 402 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  41.41 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  41.11 
 
 		 485 aa  80.1  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  46.88 
 
 		 847 aa  80.1  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  44.9 
 
 		 474 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  35.04 
 
 		 846 aa  79.7  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  40.82 
 
 		 422 aa  79.3  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  30.92 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  44.58 
 
 		 925 aa  78.2  0.0000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  42.39 
 
 		 773 aa  78.2  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  43.48 
 
 		 486 aa  77.4  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  46.34 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3495  cellulose-binding family II  42.42 
 
 		 495 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  39.18 
 
 		 913 aa  74.7  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  40.21 
 
 		 349 aa  74.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  41.77 
 
 		 681 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  43.33 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  46.34 
 
 		 459 aa  73.9  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 534 aa  74.3  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  42.22 
 
 		 702 aa  73.9  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  36.73 
 
 		 562 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  37.76 
 
 		 1209 aa  73.9  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  31.37 
 
 		 792 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0616  cellulose-binding family II protein  38.95 
 
 		 763 aa  73.6  0.000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.683683  hitchhiker  0.00244969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  45.26 
 
 		 353 aa  72.8  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  32.48 
 
 		 609 aa  72.8  0.000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  39.56 
 
 		 460 aa  72.4  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  41.6 
 
 		 468 aa  72.4  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0619  cellulose-binding family II protein  39.8 
 
 		 403 aa  72.4  0.00000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00682246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  40.2 
 
 		 447 aa  72  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  26.83 
 
 		 276 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  42.57 
 
 		 366 aa  70.9  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  42.86 
 
 		 628 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  39.56 
 
 		 2310 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  39.76 
 
 		 774 aa  70.1  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  40 
 
 		 743 aa  69.7  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  30.41 
 
 		 417 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  42.86 
 
 		 906 aa  69.7  0.00000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  43.37 
 
 		 688 aa  69.3  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  31.11 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  30.73 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  30.73 
 
 		 365 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.67 
 
 		 590 aa  68.9  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  41.46 
 
 		 744 aa  69.3  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  37.8 
 
 		 743 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  30.73 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  30.73 
 
 		 408 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  37.78 
 
 		 842 aa  68.6  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  36.73 
 
 		 1121 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  41.86 
 
 		 1298 aa  67.8  0.0000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3519  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.67 
 
 		 588 aa  67.8  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  38.46 
 
 		 494 aa  67.8  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  37.37 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4288  cellulose-binding family II  39.36 
 
 		 420 aa  67  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.016596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  28.29 
 
 		 756 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  30.28 
 
 		 449 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  37.89 
 
 		 490 aa  66.6  0.0000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3591  esterase, PHB depolymerase family  40.96 
 
 		 518 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.229813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>