More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1665 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  100 
 
 		 438 aa  892    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  52.77 
 
 		 429 aa  385  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  55.98 
 
 		 354 aa  270  4e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  39.64 
 
 		 443 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  52.4 
 
 		 389 aa  244  3e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  53.25 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  56.36 
 
 		 372 aa  238  2e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  51.32 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  47.13 
 
 		 347 aa  207  4e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  52.22 
 
 		 360 aa  201  3e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  51.23 
 
 		 358 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  45.5 
 
 		 306 aa  186  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  41.74 
 
 		 307 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  50 
 
 		 212 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  43.33 
 
 		 390 aa  160  5e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  43.19 
 
 		 391 aa  157  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  42.19 
 
 		 847 aa  156  9e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  42.36 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  45.41 
 
 		 681 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  42.36 
 
 		 388 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  44.39 
 
 		 378 aa  151  2e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.31 
 
 		 998 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  40 
 
 		 285 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  40.28 
 
 		 880 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  40.83 
 
 		 543 aa  129  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  31 
 
 		 455 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  36.76 
 
 		 393 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  39.89 
 
 		 523 aa  127  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  30 
 
 		 456 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  30.58 
 
 		 455 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  30.4 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  30.4 
 
 		 455 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  30.09 
 
 		 455 aa  122  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  38.74 
 
 		 727 aa  121  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  30.42 
 
 		 455 aa  120  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  29.48 
 
 		 455 aa  120  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0633  hypothetical protein  27.43 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.746615  normal  0.741737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  29.39 
 
 		 458 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  37.81 
 
 		 978 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  30.42 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  29.39 
 
 		 456 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  29.18 
 
 		 455 aa  117  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  31.82 
 
 		 458 aa  114  3e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4289  cellulose-binding family II  34.17 
 
 		 699 aa  110  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00315108 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  37.13 
 
 		 637 aa  110  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  48.04 
 
 		 744 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  35.1 
 
 		 1137 aa  107  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  37.7 
 
 		 658 aa  106  7e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  39.38 
 
 		 743 aa  106  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  36.36 
 
 		 497 aa  105  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  33.93 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  48.04 
 
 		 681 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  38.46 
 
 		 608 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  39.15 
 
 		 543 aa  103  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  32.38 
 
 		 674 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  50 
 
 		 488 aa  100  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  35.98 
 
 		 674 aa  100  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  35.98 
 
 		 674 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  33.04 
 
 		 395 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  27.61 
 
 		 459 aa  99.4  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  33.48 
 
 		 222 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  45.28 
 
 		 913 aa  99  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4157  cellulose-binding family II  38.64 
 
 		 719 aa  97.4  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.894149  normal  0.131999 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  41.82 
 
 		 773 aa  97.4  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  34.92 
 
 		 674 aa  97.4  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  34.15 
 
 		 362 aa  97.1  6e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  30.96 
 
 		 674 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  35.45 
 
 		 674 aa  96.3  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  37.5 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  41.6 
 
 		 851 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  34.92 
 
 		 674 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  34.92 
 
 		 674 aa  95.5  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  34.92 
 
 		 674 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  32.7 
 
 		 235 aa  95.1  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  46.6 
 
 		 774 aa  95.1  2e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  34.39 
 
 		 674 aa  94.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  43.27 
 
 		 746 aa  94.7  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  46.15 
 
 		 393 aa  94.4  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  35.64 
 
 		 973 aa  93.6  7e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6973  cellulose-binding family II  34.3 
 
 		 1007 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  41.75 
 
 		 486 aa  92.8  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5562  cellulose-binding family II  41.58 
 
 		 906 aa  92.4  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.655446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  44.12 
 
 		 743 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  41.9 
 
 		 669 aa  91.3  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0970  glycoside hydrolase family protein  47.71 
 
 		 894 aa  91.7  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.184783 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  31.6 
 
 		 368 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2048  cellulose-binding family II  30.73 
 
 		 679 aa  90.5  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  35.32 
 
 		 655 aa  90.5  6e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  34.78 
 
 		 1121 aa  89  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  35.98 
 
 		 674 aa  89.4  1e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  38.46 
 
 		 846 aa  89.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0731  cellulose-binding family II  44.04 
 
 		 934 aa  88.6  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  32.02 
 
 		 221 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  44.55 
 
 		 596 aa  87.8  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  29.79 
 
 		 392 aa  88.2  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  47.42 
 
 		 485 aa  87.8  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  46.08 
 
 		 488 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  44.66 
 
 		 446 aa  87.8  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>