239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_04370 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  100 
 
 
445 aa  887    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  50.22 
 
 
458 aa  419  1e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  48.31 
 
 
459 aa  421  1e-116  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  51.53 
 
 
455 aa  413  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  48.69 
 
 
455 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  51.06 
 
 
455 aa  410  1e-113  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  48.69 
 
 
455 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  47.67 
 
 
455 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  49.33 
 
 
458 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  49.77 
 
 
455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  49.34 
 
 
455 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  48.46 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  48.25 
 
 
455 aa  402  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  47.58 
 
 
456 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  46.56 
 
 
455 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  48.25 
 
 
455 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  46.72 
 
 
455 aa  395  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  35.08 
 
 
465 aa  212  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  33.92 
 
 
464 aa  209  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  51.85 
 
 
220 aa  206  9e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.96 
 
 
477 aa  168  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.91 
 
 
491 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  42.99 
 
 
221 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  44.71 
 
 
221 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.39 
 
 
491 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  43.5 
 
 
221 aa  165  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  48.76 
 
 
491 aa  162  8.000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.18 
 
 
491 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  45.27 
 
 
197 aa  162  1e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  43.75 
 
 
221 aa  161  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  43.75 
 
 
221 aa  161  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  44.85 
 
 
216 aa  160  4e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  43.27 
 
 
221 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  43.27 
 
 
221 aa  160  5e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  43.27 
 
 
221 aa  160  5e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  43.27 
 
 
221 aa  160  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  44.95 
 
 
221 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.72 
 
 
486 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.7 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.68 
 
 
471 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.16 
 
 
487 aa  153  5.9999999999999996e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.13 
 
 
481 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  46.07 
 
 
481 aa  152  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.13 
 
 
481 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  47.13 
 
 
481 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  44.57 
 
 
473 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.34 
 
 
485 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  47.03 
 
 
487 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  41.44 
 
 
201 aa  140  6e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  39.11 
 
 
201 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  40.3 
 
 
197 aa  128  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.91 
 
 
497 aa  123  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  44 
 
 
787 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  40.52 
 
 
749 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  40.91 
 
 
660 aa  111  3e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  33.33 
 
 
598 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  44.34 
 
 
973 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  40 
 
 
192 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.25 
 
 
6885 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  41.71 
 
 
743 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  28.96 
 
 
356 aa  97.8  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  37.97 
 
 
680 aa  90.9  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  38.3 
 
 
214 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  38.3 
 
 
214 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  38.3 
 
 
214 aa  89  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  38.3 
 
 
233 aa  89.4  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  38.3 
 
 
214 aa  89  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  38.3 
 
 
233 aa  89.4  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  37.59 
 
 
214 aa  89  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  38.3 
 
 
185 aa  87.8  3e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  36.08 
 
 
803 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  33.67 
 
 
338 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  39.71 
 
 
236 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  34.52 
 
 
2170 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  37.56 
 
 
1221 aa  85.5  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  30.85 
 
 
651 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  31.68 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  32.67 
 
 
285 aa  83.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  41.18 
 
 
729 aa  82.4  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  31.44 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  38.64 
 
 
762 aa  80.1  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  37.44 
 
 
648 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  39.47 
 
 
211 aa  77.4  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  32.46 
 
 
244 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  31.39 
 
 
211 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  35.94 
 
 
1887 aa  75.1  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  36.96 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2398  Carbohydrate binding family 6  34.31 
 
 
1004 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0137535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  35.98 
 
 
1160 aa  73.2  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  32.28 
 
 
391 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  28.28 
 
 
172 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  32.31 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  29.05 
 
 
183 aa  70.5  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0676  putative oxidoreductase, FAD-binding  34.59 
 
 
685 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3866  berberine/berberine domain-containing protein  34.59 
 
 
685 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  34.22 
 
 
429 aa  70.5  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3776  putative oxidoreductase, FAD-binding  34.59 
 
 
685 aa  70.5  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  50.62 
 
 
649 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  35.26 
 
 
1462 aa  69.7  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  35.14 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>