More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3216 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  100 
 
 		 649 aa  1312    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2684  glycoside hydrolase family protein  63.77 
 
 		 658 aa  801    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.954713  normal  0.0577257 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2712  cellulase  68.63 
 
 		 619 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  61.07 
 
 		 597 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2820  glycoside hydrolase family protein  63.02 
 
 		 633 aa  551  1e-155  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000391085  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0734  glycoside hydrolase family 5  61.59 
 
 		 580 aa  539  9.999999999999999e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0560838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0405  glycoside hydrolase family protein  52.55 
 
 		 526 aa  509  1e-143  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000478388  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1866  Mannan endo-1,4-beta-mannosidase., Cellulase  52.96 
 
 		 1414 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0740  glycoside hydrolase family 5  45.59 
 
 		 534 aa  431  1e-119  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.209978  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2872  glycoside hydrolase family protein  49.32 
 
 		 566 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1163  cellulase  47.23 
 
 		 468 aa  422  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2147  glycoside hydrolase family protein  46.73 
 
 		 660 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2337  glycoside hydrolase family 5  44.81 
 
 		 539 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0536  glycoside hydrolase family protein  41.58 
 
 		 563 aa  377  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000215938  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  38.41 
 
 		 608 aa  342  1e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0159  Cellulase  38.4 
 
 		 542 aa  228  2e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  34.96 
 
 		 2305 aa  222  9.999999999999999e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  34.1 
 
 		 2310 aa  207  6e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  35.09 
 
 		 562 aa  204  4e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04151  major extracellular endoglucanase  33.59 
 
 		 480 aa  172  2e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2102  cellulase  32.19 
 
 		 496 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.104361  normal  0.672639 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1953  cellulase  31.73 
 
 		 614 aa  156  1e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.253499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  52.02 
 
 		 655 aa  152  3e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  53.59 
 
 		 900 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  47.98 
 
 		 847 aa  149  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  29.72 
 
 		 523 aa  137  6.0000000000000005e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  48.91 
 
 		 460 aa  134  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  48.24 
 
 		 743 aa  130  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  42.93 
 
 		 681 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  48.82 
 
 		 543 aa  123  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  47.12 
 
 		 973 aa  119  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  38.73 
 
 		 1137 aa  117  6e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2492  endo-1,4-beta-glucanase/xyloglucanase, putative, gly74A  46.05 
 
 		 978 aa  114  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0351052  normal  0.027518 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40.72 
 
 		 1121 aa  113  9e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  43.39 
 
 		 543 aa  110  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  38.38 
 
 		 637 aa  106  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  43.98 
 
 		 429 aa  104  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1113  glycoside hydrolase family protein  27.2 
 
 		 440 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  58 
 
 		 703 aa  103  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  38.17 
 
 		 998 aa  100  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0497  chitinase B  36.04 
 
 		 674 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4874  chitinase B  35.53 
 
 		 674 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0498  chitinase B  35.86 
 
 		 674 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  53.92 
 
 		 1154 aa  98.2  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0450  chitinase B  34.52 
 
 		 674 aa  97.4  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.650007  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0366  glycoside hydrolase family protein  36.36 
 
 		 674 aa  97.4  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0428  chitinase B  36.04 
 
 		 674 aa  97.4  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0371  chitinase B  36.04 
 
 		 674 aa  97.4  8e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0362  chitinase  36.04 
 
 		 674 aa  97.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0385  chitinase B  36.04 
 
 		 674 aa  97.4  8e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0359  chitinase  35.53 
 
 		 674 aa  96.7  1e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2176  endoglucanase  35.98 
 
 		 880 aa  96.3  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0658592  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1010  glycoside hydrolase family protein  26.04 
 
 		 440 aa  94.7  5e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4225  glycoside hydrolase family 5  26.69 
 
 		 632 aa  92.4  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.366342  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  52.04 
 
 		 552 aa  91.7  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0861  glycoside hydrolase family 5  25.54 
 
 		 642 aa  89.4  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.025002 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  52 
 
 		 614 aa  89.7  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  37.02 
 
 		 438 aa  89  3e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  41.18 
 
 		 924 aa  88.6  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  54.88 
 
 		 1209 aa  87  9e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  25.66 
 
 		 725 aa  85.5  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6640  cellulose-binding family II  37.91 
 
 		 727 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0877502 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  53.93 
 
 		 2170 aa  84.3  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  48.25 
 
 		 702 aa  83.2  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  56.25 
 
 		 561 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  46.07 
 
 		 455 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  48.94 
 
 		 820 aa  82  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  52.75 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  45 
 
 		 474 aa  81.6  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  47.66 
 
 		 673 aa  81.6  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  35.84 
 
 		 443 aa  81.6  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  44.94 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  44.94 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  54.74 
 
 		 795 aa  80.9  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  47.42 
 
 		 372 aa  80.5  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0373  glycoside hydrolase family protein  31.96 
 
 		 674 aa  80.5  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  43.82 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  50 
 
 		 456 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  43.82 
 
 		 455 aa  79.7  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.05 
 
 		 6885 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  47 
 
 		 493 aa  79.7  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  47.19 
 
 		 455 aa  79.3  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  49.46 
 
 		 455 aa  79  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  53.61 
 
 		 762 aa  78.6  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  48.89 
 
 		 680 aa  78.6  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  42.7 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  42.7 
 
 		 455 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  42.7 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  41.57 
 
 		 455 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  46.34 
 
 		 749 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  43.82 
 
 		 787 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  51.06 
 
 		 1887 aa  76.6  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0812  hypothetical protein  46.43 
 
 		 1200 aa  75.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  41.57 
 
 		 458 aa  75.9  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4691  Fibronectin type III domain protein  54.35 
 
 		 544 aa  75.5  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.354116  normal  0.211382 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  51.72 
 
 		 1298 aa  75.5  0.000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5622  fibronectin type III domain-containing protein  45.12 
 
 		 660 aa  75.1  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3336  Glycosidase-like protein  46.08 
 
 		 997 aa  75.1  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.310456  normal  0.29304 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  49.02 
 
 		 445 aa  75.1  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  45.35 
 
 		 448 aa  74.7  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>