115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1030 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  74.05 
 
 		 491 aa  756    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  100 
 
 		 481 aa  998    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  74.05 
 
 		 491 aa  756    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  74.47 
 
 		 491 aa  759    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  79 
 
 		 481 aa  806    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  78.96 
 
 		 481 aa  806    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  79.21 
 
 		 481 aa  809    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  79.42 
 
 		 481 aa  800    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  61.68 
 
 		 477 aa  627  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  50.11 
 
 		 473 aa  475  1e-133  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  41.53 
 
 		 471 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  45.53 
 
 		 485 aa  375  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.8 
 
 		 491 aa  373  1e-102  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  43.56 
 
 		 487 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.09 
 
 		 487 aa  370  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.19 
 
 		 497 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.44 
 
 		 486 aa  264  2e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  54.26 
 
 		 197 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  54.02 
 
 		 221 aa  207  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  52.87 
 
 		 221 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  52.87 
 
 		 221 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  52.87 
 
 		 221 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  52.87 
 
 		 221 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  52.3 
 
 		 221 aa  203  4e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  52.3 
 
 		 221 aa  203  4e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  52.3 
 
 		 221 aa  202  8e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  53.25 
 
 		 216 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  51.72 
 
 		 221 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  51.72 
 
 		 221 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  45.08 
 
 		 455 aa  177  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  45.08 
 
 		 455 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  43.72 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  44.04 
 
 		 455 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  44.21 
 
 		 455 aa  174  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  45.08 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  45.08 
 
 		 455 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  43.52 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  43.52 
 
 		 455 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  42.49 
 
 		 455 aa  170  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  42.93 
 
 		 459 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  43.16 
 
 		 455 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  44.44 
 
 		 458 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  39.37 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  43.68 
 
 		 201 aa  166  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  40.09 
 
 		 456 aa  165  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  43.81 
 
 		 220 aa  161  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  42.71 
 
 		 458 aa  155  2e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  39.3 
 
 		 201 aa  154  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  46.07 
 
 		 445 aa  152  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  40.1 
 
 		 197 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  34.2 
 
 		 236 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  29.47 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  25.75 
 
 		 388 aa  106  9e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  27.21 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  33.82 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  29.32 
 
 		 391 aa  101  4e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  37.93 
 
 		 172 aa  97.8  4e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  34.95 
 
 		 171 aa  96.3  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  33.16 
 
 		 244 aa  95.1  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  35.03 
 
 		 245 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  24.76 
 
 		 378 aa  91.7  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  29.21 
 
 		 214 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 214 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  29.21 
 
 		 214 aa  87.8  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  29.21 
 
 		 214 aa  87.8  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  28.37 
 
 		 214 aa  87.4  5e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 233 aa  87.4  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  29.35 
 
 		 233 aa  87.4  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 266 aa  86.7  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  33.53 
 
 		 251 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 356 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  31.94 
 
 		 266 aa  84.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  33.68 
 
 		 651 aa  84.3  0.000000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  30.35 
 
 		 211 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  32.12 
 
 		 262 aa  84  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  36.76 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 338 aa  83.6  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  32.17 
 
 		 185 aa  80.1  0.00000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  31.98 
 
 		 183 aa  79.7  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  31.36 
 
 		 313 aa  78.2  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  29.41 
 
 		 211 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  26.04 
 
 		 307 aa  67  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  23.97 
 
 		 247 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  25.21 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  23.95 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  26.59 
 
 		 729 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  26.59 
 
 		 729 aa  62.4  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  28.19 
 
 		 368 aa  60.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  28.43 
 
 		 285 aa  60.8  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  27.36 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 405 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  26.9 
 
 		 699 aa  58.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  34.48 
 
 		 389 aa  57  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  51.92 
 
 		 1204 aa  55.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  27.06 
 
 		 395 aa  55.8  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  26.58 
 
 		 347 aa  54.3  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  26.95 
 
 		 727 aa  53.5  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  26.7 
 
 		 400 aa  53.5  0.000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  60.53 
 
 		 972 aa  53.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>