139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05899 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4085  chitinase A  58.01 
 
 		 699 aa  831    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  100 
 
 		 729 aa  1489    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05656  chitinase  73 
 
 		 565 aa  801    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  100 
 
 		 729 aa  1489    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  58.96 
 
 		 727 aa  881    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2205  glycosyl hydrolase family chitinase  53.58 
 
 		 492 aa  375  1e-102  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  56.12 
 
 		 484 aa  369  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3568  glycosyl hydrolase family chitinase  54.77 
 
 		 353 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.285696 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34870  chitinase  51.6 
 
 		 483 aa  355  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0143949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2949  chitinase  51.9 
 
 		 483 aa  353  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  43.17 
 
 		 803 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  49.72 
 
 		 598 aa  340  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0611  glycosy hydrolase family protein  47.9 
 
 		 471 aa  296  8e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0693  glycoside hydrolase family protein  48.22 
 
 		 471 aa  296  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl347  chitinase  36.3 
 
 		 1113 aa  174  5.999999999999999e-42  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2184  Chitinase  29.65 
 
 		 1362 aa  148  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00723588 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2310  bacillolysin  46.36 
 
 		 886 aa  125  3e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.105645  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3483  chitinase  28.14 
 
 		 360 aa  125  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.219436  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3571  extracellular exochitinase Chi36  28.14 
 
 		 360 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.297633  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3469  chitinase  28.14 
 
 		 360 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3854  extracellular exochitinase Chi36  28.14 
 
 		 360 aa  124  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.063231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2624  bacillolysin  43.48 
 
 		 891 aa  124  7e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000636329  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  29.57 
 
 		 551 aa  123  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2571  neutral protease A, bacillolysin  45.52 
 
 		 891 aa  122  3e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000442231  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3775  extracellular exochitinase Chi36  28.74 
 
 		 360 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000559542  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2534  neutral protease  43.03 
 
 		 887 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.596256  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2581  neutral protease  44.67 
 
 		 884 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011855 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2348  bacillolysin (neutral protease)  44.37 
 
 		 890 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00113983  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1540  chitinase  29.91 
 
 		 846 aa  119  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.987868  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2789  bacillolysin  45.64 
 
 		 893 aa  119  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000716183  hitchhiker  0.000000152737 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3490  glycoside hydrolase family protein  28.74 
 
 		 360 aa  117  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.678093  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3753  extracellular exochitinase Chi36  28.14 
 
 		 360 aa  117  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.007807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2393  thermolysin metallopeptidase  42.77 
 
 		 530 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0757  endochitinase ChiA  28.81 
 
 		 846 aa  116  2.0000000000000002e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1704  glycosyl hydrolase family chitinase  28.71 
 
 		 543 aa  114  7.000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.861913 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1478  extracellular exochitinase Chi36  27.84 
 
 		 360 aa  114  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.17366  hitchhiker  0.000283046 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3824  extracellular exochitinase Chi36  27.54 
 
 		 360 aa  109  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03258  chitinase  29.6 
 
 		 846 aa  109  2e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002720  chitinase  29.6 
 
 		 848 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.548595  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  28.05 
 
 		 648 aa  106  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4555  glycoside hydrolase family protein  26.71 
 
 		 1578 aa  105  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1220  Carbohydrate-binding CenC domain protein  30.32 
 
 		 510 aa  104  7e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  28.76 
 
 		 420 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7432  Chitinase-like protein  28.3 
 
 		 516 aa  97.1  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.894433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  27.22 
 
 		 680 aa  95.5  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4053  glycoside hydrolase family 18  25 
 
 		 376 aa  92.4  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0226392 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4225  Carbohydrate-binding CenC domain protein  27.99 
 
 		 551 aa  91.7  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0637754 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2383  putative surface protein  39.18 
 
 		 929 aa  89.4  2e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.13211  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1458  glycosyl hydrolase family chitinase  27.2 
 
 		 460 aa  88.2  6e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0735  glycoside hydrolase family 18  28.49 
 
 		 341 aa  85.1  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  28.57 
 
 		 613 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2965  cellulose-binding family II protein  27.41 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.432243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.93 
 
 		 497 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  41.67 
 
 		 855 aa  76.3  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.58 
 
 		 471 aa  74.7  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.31 
 
 		 491 aa  73.6  0.00000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  47.22 
 
 		 1204 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  41.33 
 
 		 848 aa  73.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3735  extracellular exochitinase Chi36  32.12 
 
 		 189 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.72466e-18 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.07 
 
 		 491 aa  72  0.00000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24870  predicted xylanase/chitin deacetylase  37.59 
 
 		 503 aa  70.9  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.57 
 
 		 491 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  42.67 
 
 		 848 aa  70.5  0.0000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  40.16 
 
 		 565 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  45.71 
 
 		 443 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.91 
 
 		 485 aa  70.1  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0647  chitinase-related protein  45.95 
 
 		 105 aa  69.3  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.03 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.21 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.03 
 
 		 481 aa  67.8  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.82 
 
 		 487 aa  67.4  0.0000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.43 
 
 		 491 aa  66.6  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3186  cellulose-binding family II protein  29.25 
 
 		 467 aa  66.2  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00151543 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  25.97 
 
 		 487 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.74 
 
 		 481 aa  65.5  0.000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  62.79 
 
 		 772 aa  65.1  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.32 
 
 		 477 aa  64.3  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.54 
 
 		 647 aa  64.3  0.000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  66.67 
 
 		 426 aa  63.9  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  60.98 
 
 		 395 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  59.52 
 
 		 402 aa  62.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  60.98 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  26.59 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  33.33 
 
 		 816 aa  62.4  0.00000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  29.75 
 
 		 1057 aa  61.6  0.00000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  32.37 
 
 		 2638 aa  61.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  51.85 
 
 		 972 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1073  discoidin domain-containing protein  45.33 
 
 		 2142 aa  60.1  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.742063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  52.94 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  47.83 
 
 		 651 aa  57.8  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1122  hypothetical protein  39.73 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0136739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1144  hypothetical protein  39.73 
 
 		 105 aa  57.4  0.0000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0791111  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01990  hypothetical protein  24.54 
 
 		 582 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  40.26 
 
 		 765 aa  57  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.85 
 
 		 473 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  51.11 
 
 		 393 aa  55.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  25.91 
 
 		 792 aa  53.9  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2684  Endo-1,4-beta-xylanase  32.39 
 
 		 1242 aa  52.4  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4362  PHB depolymerase family esterase  43.75 
 
 		 576 aa  52.8  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.88 
 
 		 699 aa  52  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>