236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0490 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 		 313 aa  639    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  47.09 
 
 		 651 aa  169  5e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  43.41 
 
 		 356 aa  162  1e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  45.11 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  47.4 
 
 		 245 aa  148  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  46.55 
 
 		 251 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  49.02 
 
 		 183 aa  146  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  40 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  39.23 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  44.44 
 
 		 172 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  42.13 
 
 		 266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  39.88 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  42.51 
 
 		 362 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  41.57 
 
 		 171 aa  122  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  33.73 
 
 		 351 aa  110  2.0000000000000002e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  28.07 
 
 		 368 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  37.36 
 
 		 201 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  35.96 
 
 		 458 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  36.46 
 
 		 201 aa  98.2  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  33.5 
 
 		 456 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  33.17 
 
 		 221 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  34.2 
 
 		 221 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  34.2 
 
 		 221 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  34.2 
 
 		 221 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  34.2 
 
 		 221 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  33.5 
 
 		 456 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  34.2 
 
 		 221 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  34.2 
 
 		 221 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  34.2 
 
 		 221 aa  94.7  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  34.2 
 
 		 221 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  34.52 
 
 		 197 aa  94.4  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  36.36 
 
 		 197 aa  93.6  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.12 
 
 		 491 aa  92.8  7e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  34.22 
 
 		 221 aa  92.8  7e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  47.71 
 
 		 702 aa  92.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2024  glycoside hydrolase family 10  48.18 
 
 		 756 aa  92.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3558  glycoside hydrolase family 10  51.65 
 
 		 820 aa  92.4  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  45.8 
 
 		 468 aa  91.7  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.12 
 
 		 491 aa  92  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  32.47 
 
 		 216 aa  92.4  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  33.68 
 
 		 455 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  33.68 
 
 		 455 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  35.61 
 
 		 458 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.63 
 
 		 481 aa  90.9  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  33.68 
 
 		 455 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.68 
 
 		 455 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.63 
 
 		 481 aa  90.1  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.63 
 
 		 481 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.85 
 
 		 491 aa  89.4  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  33.16 
 
 		 455 aa  89.4  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  33.16 
 
 		 455 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  33.16 
 
 		 455 aa  88.6  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1429  cellulose-binding family II  50 
 
 		 471 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0718119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.95 
 
 		 481 aa  88.2  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  33.16 
 
 		 455 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  33.16 
 
 		 455 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  32.63 
 
 		 455 aa  87.4  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  51.61 
 
 		 900 aa  87  3e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  34.38 
 
 		 459 aa  87  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  32.2 
 
 		 455 aa  87  4e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  52.22 
 
 		 655 aa  85.5  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  28.41 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  37.29 
 
 		 443 aa  84  0.000000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  42.11 
 
 		 846 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  37.87 
 
 		 372 aa  83.6  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  31.55 
 
 		 220 aa  82.8  0.000000000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  38.57 
 
 		 453 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  26.15 
 
 		 347 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.66 
 
 		 471 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.26 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  49 
 
 		 447 aa  80.9  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.57 
 
 		 481 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0338  cellulose-binding family II  43.48 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.247648  normal  0.0804617 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.07 
 
 		 486 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  45.1 
 
 		 449 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  46.24 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  43.3 
 
 		 593 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  35.03 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  45.24 
 
 		 451 aa  72.8  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  45.24 
 
 		 460 aa  72  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  45.24 
 
 		 545 aa  71.6  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.8 
 
 		 473 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  25.59 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0504  glycoside hydrolase family 5  53.33 
 
 		 445 aa  69.3  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  26.89 
 
 		 400 aa  69.7  0.00000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  41.41 
 
 		 673 aa  68.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2774  cellulose-binding family II  54.12 
 
 		 89 aa  67.8  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.691497  normal  0.395894 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0933  Beta-1 4-xylanase-like protein  49.46 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.258206  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  39.53 
 
 		 478 aa  66.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  31.22 
 
 		 445 aa  65.9  0.0000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3214  Endo-1,4-beta-xylanase  40.21 
 
 		 457 aa  65.5  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.176757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2830  family 6 glycoside hydrolase  46.51 
 
 		 456 aa  65.5  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.426426  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  46.51 
 
 		 422 aa  65.1  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  43.21 
 
 		 532 aa  64.7  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  43.33 
 
 		 649 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  45.45 
 
 		 441 aa  64.3  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  39 
 
 		 477 aa  63.9  0.000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.46 
 
 		 487 aa  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0934  putative secreted beta-mannosidase  48.28 
 
 		 523 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0660492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.29 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>