110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3599 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 245 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  66.12 
 
 		 244 aa  301  6.000000000000001e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  58.75 
 
 		 262 aa  293  2e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  63.2 
 
 		 251 aa  292  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  53.79 
 
 		 338 aa  280  2e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  50.34 
 
 		 356 aa  278  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  54.51 
 
 		 266 aa  266  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  54.33 
 
 		 266 aa  265  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  61.99 
 
 		 171 aa  199  3e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  58.94 
 
 		 172 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  58.5 
 
 		 183 aa  181  9.000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  41.59 
 
 		 651 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  45.96 
 
 		 313 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  42.56 
 
 		 201 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  42.78 
 
 		 197 aa  141  9.999999999999999e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  43.85 
 
 		 201 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  35.96 
 
 		 285 aa  134  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  32.63 
 
 		 458 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  38.66 
 
 		 221 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  38.66 
 
 		 221 aa  118  9e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  37.13 
 
 		 221 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  38.3 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  37.23 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  38.3 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  37.23 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  37.23 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  38.3 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  37.23 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.22 
 
 		 481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.22 
 
 		 481 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.22 
 
 		 481 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  34.48 
 
 		 456 aa  111  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.66 
 
 		 477 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  36.13 
 
 		 456 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  33.5 
 
 		 459 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  35.91 
 
 		 481 aa  107  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  35.16 
 
 		 197 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  29.87 
 
 		 307 aa  104  1e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.03 
 
 		 458 aa  102  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  34.92 
 
 		 455 aa  101  9e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.92 
 
 		 455 aa  101  9e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  35.45 
 
 		 455 aa  101  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.92 
 
 		 455 aa  101  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  34.92 
 
 		 455 aa  101  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  34.92 
 
 		 455 aa  101  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.84 
 
 		 481 aa  100  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  33.86 
 
 		 455 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  34.39 
 
 		 455 aa  99  6e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  34.39 
 
 		 455 aa  99  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  34.39 
 
 		 455 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  34.39 
 
 		 455 aa  99  7e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  33.51 
 
 		 491 aa  99  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.99 
 
 		 491 aa  97.1  2e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  31.46 
 
 		 220 aa  96.3  4e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.32 
 
 		 491 aa  95.5  7e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  30.91 
 
 		 486 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  32.29 
 
 		 471 aa  93.6  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.38 
 
 		 473 aa  93.2  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.51 
 
 		 491 aa  88.2  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.25 
 
 		 487 aa  87.4  2e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  31.69 
 
 		 487 aa  85.9  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  29.52 
 
 		 485 aa  79.3  0.00000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  27.72 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  31.13 
 
 		 497 aa  75.1  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2317  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  66.67 
 
 		 457 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.702389  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7854  Protocatechuate 3 4-dioxygenase beta subunit- like protein  65.91 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2713  intradiol ring-cleavage dioxygenase  57.69 
 
 		 271 aa  72.4  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.655559  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2494  glycoside hydrolase family protein  40.74 
 
 		 904 aa  69.7  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3895  Zinc metalloprotease (elastase)-like protein  71.05 
 
 		 1077 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1818  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  34.3 
 
 		 477 aa  68.9  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000535261  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  66.67 
 
 		 551 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  28.7 
 
 		 393 aa  67.4  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  66.67 
 
 		 561 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2193  carbohydrate-binding family V/XII protein  63.64 
 
 		 790 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00201516  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  64.29 
 
 		 492 aa  62.8  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6846  Chitinase  61.36 
 
 		 855 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.403057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  50.79 
 
 		 652 aa  61.6  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  27.6 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2431  licheninase  44.29 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000786066  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  25.88 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  25.26 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  24.76 
 
 		 391 aa  54.7  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2750  chitinase  54.05 
 
 		 521 aa  53.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  23.98 
 
 		 389 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  27.52 
 
 		 389 aa  52.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  25.25 
 
 		 464 aa  51.6  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  24.81 
 
 		 388 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0400  chitinase  47.73 
 
 		 598 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.0000106126  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  27.45 
 
 		 360 aa  49.7  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  24.7 
 
 		 214 aa  49.3  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  23.47 
 
 		 236 aa  48.5  0.00009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1223  glycoside hydrolase family protein  29.19 
 
 		 484 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0824686  normal  0.0476273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  30.94 
 
 		 429 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  22.73 
 
 		 347 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  50 
 
 		 465 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  24.07 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  24.07 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  24.07 
 
 		 214 aa  46.2  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>