124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1611 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  100 
 
 
201 aa  410  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  62.38 
 
 
201 aa  256  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  54.82 
 
 
197 aa  208  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.71 
 
 
491 aa  174  7e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.71 
 
 
491 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  49.21 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  49.21 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.21 
 
 
491 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  50.29 
 
 
216 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  47.45 
 
 
221 aa  171  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  47.45 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  47.45 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  46.94 
 
 
221 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  46.94 
 
 
221 aa  169  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  46.94 
 
 
221 aa  169  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.08 
 
 
477 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  46.94 
 
 
221 aa  169  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  46.7 
 
 
197 aa  167  1e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.93 
 
 
481 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.93 
 
 
481 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  45.31 
 
 
221 aa  163  1.0000000000000001e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.93 
 
 
481 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.6 
 
 
481 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  39.3 
 
 
481 aa  154  7e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  42.08 
 
 
486 aa  153  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  43.43 
 
 
458 aa  154  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  43 
 
 
456 aa  153  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4108  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.32 
 
 
473 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  43.3 
 
 
471 aa  150  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  42.5 
 
 
456 aa  149  2e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  43.37 
 
 
458 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  44.51 
 
 
459 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  43.09 
 
 
455 aa  144  6e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  43.09 
 
 
455 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  42.55 
 
 
455 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  42.55 
 
 
455 aa  143  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  42.55 
 
 
455 aa  143  2e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  43.09 
 
 
455 aa  143  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  42.55 
 
 
455 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  43.09 
 
 
455 aa  142  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3599  hypothetical protein  42.86 
 
 
245 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.488922  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  43.09 
 
 
455 aa  141  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.21 
 
 
487 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  38.5 
 
 
491 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  41.34 
 
 
487 aa  139  3e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1483  chitin-binding domain-containing protein  44.95 
 
 
244 aa  139  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.815729  hitchhiker  0.000167974 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  39.11 
 
 
445 aa  138  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  41.49 
 
 
455 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  41.49 
 
 
455 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  40.82 
 
 
485 aa  136  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5303  chitin-binding domain 3 protein  43.89 
 
 
172 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.43185  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1647  chitin-binding domain-containing protein  42.78 
 
 
356 aa  133  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0765002  normal  0.540301 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  37.21 
 
 
220 aa  131  9e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4281  chitin-binding domain 3 protein  44.13 
 
 
183 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148195  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0283  chitin-binding protein  42.35 
 
 
251 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5334  chitin-binding domain 3 protein  43.59 
 
 
262 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.509642  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1632  chitin-binding domain-containing protein  43.68 
 
 
338 aa  127  9.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  37.37 
 
 
497 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2456  chitin-binding domain-containing protein  42.25 
 
 
266 aa  122  5e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.361389  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4858  chitin-binding domain-containing protein  42.25 
 
 
266 aa  122  5e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.667508  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5107  chitin-binding domain 3 protein  39.39 
 
 
171 aa  121  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.687229  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6726  chitin-binding protein  37.17 
 
 
236 aa  121  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1381  Chitinase  40.2 
 
 
651 aa  119  1.9999999999999998e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.456861  normal  0.0706322 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3219  chitin binding protein, putative  34.5 
 
 
214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
307 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3569  chitin-binding domain-containing protein  33.99 
 
 
211 aa  107  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.833618  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5855  chitin-binding domain-containing protein  34.87 
 
 
192 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.78659  normal  0.147977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0797  chitin-binding domain-containing protein  34.85 
 
 
211 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.515634  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2896  chitin binding protein, putative  32.5 
 
 
214 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555035  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0114  chitin binding domain-containing protein  32.5 
 
 
214 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.116887  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1645  putative chitin binding protein  32.5 
 
 
214 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3898  chitin-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.633676  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3979  chitin-binding domain-containing protein  32.5 
 
 
214 aa  103  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.173041  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3076  putative chitin binding protein  32.5 
 
 
233 aa  103  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0610  fibronectin type III domain-containing protein/ chitin binding domain-containing protein  32.5 
 
 
464 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0692  fibronectin type III domain-containing protein  32 
 
 
465 aa  98.6  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0490  chitin-binding domain 3 protein  35.75 
 
 
313 aa  98.6  6e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0145571 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  34.01 
 
 
285 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  34 
 
 
360 aa  95.9  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  34.5 
 
 
358 aa  96.3  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  34.05 
 
 
359 aa  94.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  33.33 
 
 
347 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  33.5 
 
 
390 aa  91.7  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3474  putative chitin binding protein  31.38 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  38.89 
 
 
389 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  38.89 
 
 
388 aa  89  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  30.6 
 
 
400 aa  87.8  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2978  chitin-binding protein, putative  27.39 
 
 
249 aa  85.9  4e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00351674  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  32.66 
 
 
429 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2856  chitin-binding domain-containing protein  27.08 
 
 
247 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0288918 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  30.69 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  33 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  36.29 
 
 
378 aa  80.9  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  30.14 
 
 
438 aa  78.6  0.00000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  28.77 
 
 
393 aa  78.6  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  35.71 
 
 
389 aa  78.2  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  29.05 
 
 
391 aa  76.3  0.0000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  30.28 
 
 
443 aa  71.2  0.000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  30.49 
 
 
368 aa  68.9  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  26.55 
 
 
222 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>