82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4875 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4875  carbohydrate-binding family V/XII protein  100 
 
 		 647 aa  1341    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3671  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.2 
 
 		 580 aa  150  5e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5472  fibronectin type III domain-containing protein  29.26 
 
 		 787 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000573168  decreased coverage  0.000436266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3415  microbial collagenase  32.62 
 
 		 459 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000959102  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1830  microbial collagenase  31.49 
 
 		 458 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000167843  normal  0.0782319 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5678  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  34.5 
 
 		 546 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0596714  decreased coverage  0.000827324 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1214  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.24 
 
 		 785 aa  114  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1091  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.42 
 
 		 739 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1437  serine protease, subtilase family  34.44 
 
 		 613 aa  110  5e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000606827  hitchhiker  0.00102573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3861  serine protease, subtilase family  35.53 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3514  serine protease  33.9 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000105585  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3502  serine protease  33.9 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000122382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3772  serine protease, subtilase family  34.87 
 
 		 613 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000373923 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6938  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.31 
 
 		 529 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3892  serine protease  33.9 
 
 		 613 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000928217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3605  serine protease  33.9 
 
 		 613 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.139386  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3794  serine protease  34.04 
 
 		 613 aa  107  7e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000410497  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  36.84 
 
 		 471 aa  86.3  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2217  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0636  carbohydrate-binding family V/XII protein  58.93 
 
 		 765 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.393474  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  28.52 
 
 		 298 aa  75.1  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 		 298 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3655  glycoside hydrolase family protein  34.21 
 
 		 727 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00548  chitinase  36.54 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05899  chitinase  36.54 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02195  chitinase  52.08 
 
 		 182 aa  62.8  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2364  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.86 
 
 		 634 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4085  chitinase A  33.04 
 
 		 699 aa  57.4  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0119  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.46 
 
 		 587 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.165742 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40456  predicted protein  28.07 
 
 		 834 aa  55.5  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.34 
 
 		 771 aa  54.3  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4306  Chitinase  47.06 
 
 		 772 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.594159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2882  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.92 
 
 		 939 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04562  extracellular protease  26.56 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04561  extracellular protease  27.8 
 
 		 560 aa  52  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.550722  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  29.01 
 
 		 395 aa  52.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 405 aa  52  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3770  glycoside hydrolase family 18  44.9 
 
 		 420 aa  51.6  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000945  chitinase  44 
 
 		 848 aa  51.6  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  50 
 
 		 392 aa  51.2  0.00006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6479  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.44 
 
 		 739 aa  50.4  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2604  glycoside hydrolase family protein  42 
 
 		 1127 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0488265  hitchhiker  0.00483231 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1860  glycoside hydrolase family 18  42 
 
 		 1127 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.686097  hitchhiker  0.0000000988456 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  42.37 
 
 		 402 aa  49.7  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.53 
 
 		 1054 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06955  chitinase  30.53 
 
 		 855 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4740  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.32 
 
 		 1217 aa  48.9  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.51333  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04030  subtilisin-like serine protease  27.39 
 
 		 641 aa  48.9  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 		 500 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  23.68 
 
 		 1315 aa  48.5  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003394  putative trypsin  46.67 
 
 		 443 aa  48.1  0.0005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0229  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.86 
 
 		 498 aa  48.1  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1249  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.74 
 
 		 431 aa  47.4  0.0009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.613624  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2484  glycoside hydrolase family protein  40 
 
 		 1127 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.1184  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0106  chitinase  51.43 
 
 		 848 aa  47  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6261  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.25 
 
 		 427 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0744  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.99 
 
 		 1092 aa  47.4  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0783948  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2491  glycoside hydrolase family 18  40 
 
 		 1127 aa  46.6  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  26.71 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0712  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.47 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.482553 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28842  predicted protein  33.62 
 
 		 398 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.991697  normal  0.128685 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.83 
 
 		 491 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_4493  predicted protein  39.45 
 
 		 449 aa  45.8  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0320757 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1368  Cellulase  41.51 
 
 		 426 aa  45.8  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1096  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.81 
 
 		 589 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0647  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.64 
 
 		 836 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000368401 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1125  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.81 
 
 		 589 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.798248  normal  0.349528 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.83 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3122  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.77 
 
 		 1205 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.950129  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  27.83 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  31.03 
 
 		 397 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  31.03 
 
 		 397 aa  44.7  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.36 
 
 		 483 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  31.03 
 
 		 397 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  31.03 
 
 		 397 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  31.9 
 
 		 397 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  31.03 
 
 		 397 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  31.9 
 
 		 397 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  31.03 
 
 		 397 aa  44.7  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  31.03 
 
 		 397 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  32.95 
 
 		 1057 aa  43.9  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3093  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.61 
 
 		 835 aa  43.9  0.01  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.479186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>