97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3293 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  100 
 
 		 534 aa  1104    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  100 
 
 		 534 aa  1104    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  100 
 
 		 534 aa  1104    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  55.36 
 
 		 449 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  54.14 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  54.14 
 
 		 408 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  54.14 
 
 		 365 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  54.14 
 
 		 365 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  54.14 
 
 		 365 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  54.12 
 
 		 417 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  54.14 
 
 		 378 aa  344  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  36.21 
 
 		 392 aa  196  7e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  35.54 
 
 		 405 aa  195  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  35.57 
 
 		 402 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  36.83 
 
 		 395 aa  179  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  31.61 
 
 		 497 aa  144  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  36.95 
 
 		 276 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  31.61 
 
 		 378 aa  120  6e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  30.75 
 
 		 390 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  30.79 
 
 		 389 aa  100  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  29.61 
 
 		 388 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  32.91 
 
 		 307 aa  98.2  4e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  26.57 
 
 		 391 aa  95.9  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  30.53 
 
 		 285 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  31.16 
 
 		 443 aa  93.6  8e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  32.31 
 
 		 359 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.87 
 
 		 497 aa  90.1  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  30.28 
 
 		 306 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  31.38 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4239  N-acetylglucosamine-binding protein A  25.05 
 
 		 471 aa  80.9  0.00000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.225029 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  30.77 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  30.37 
 
 		 358 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  28.76 
 
 		 235 aa  75.1  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  27.2 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  29.91 
 
 		 360 aa  74.3  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  30.4 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  30.17 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  29.09 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  29.95 
 
 		 368 aa  68.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  28.12 
 
 		 393 aa  67  0.0000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.38 
 
 		 477 aa  65.9  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  27.87 
 
 		 400 aa  65.5  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  26.03 
 
 		 351 aa  65.1  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2206  hypothetical protein  30.13 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04739  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.13 
 
 		 487 aa  64.3  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  27.43 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  34.06 
 
 		 429 aa  63.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0423  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.06 
 
 		 485 aa  61.6  0.00000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0208095  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001124  chitin binding protein  23.28 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.177583  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  28.44 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  30.41 
 
 		 362 aa  60.5  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  22.81 
 
 		 486 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  40.82 
 
 		 212 aa  57.4  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  27.75 
 
 		 201 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  27.82 
 
 		 223 aa  56.2  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  27.31 
 
 		 221 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  27.31 
 
 		 221 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1030  N-acetylglucosamine-binding protein A  22.95 
 
 		 481 aa  54.7  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0134  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.04 
 
 		 491 aa  54.3  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271889  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  27.8 
 
 		 221 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  27.49 
 
 		 221 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  27.8 
 
 		 221 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  27.8 
 
 		 221 aa  54.3  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  27.8 
 
 		 221 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  27.8 
 
 		 221 aa  53.9  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  27.8 
 
 		 221 aa  53.9  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  22.81 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1428  chitinase  28.39 
 
 		 972 aa  53.5  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  22.38 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  22.57 
 
 		 481 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  22.38 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1101  chitinase  29.14 
 
 		 565 aa  52  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  31.85 
 
 		 197 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  30.83 
 
 		 445 aa  52  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  21.71 
 
 		 491 aa  50.8  0.00006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  26.8 
 
 		 221 aa  50.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  29.22 
 
 		 1204 aa  50.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  27.73 
 
 		 458 aa  50.4  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  31.34 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  31.34 
 
 		 455 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  25.66 
 
 		 216 aa  50.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  29.5 
 
 		 456 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  29.58 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  30 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  30.6 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  29.58 
 
 		 455 aa  48.1  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  29.32 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  29.85 
 
 		 455 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  29.29 
 
 		 455 aa  46.2  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  29.17 
 
 		 816 aa  45.1  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  23.18 
 
 		 197 aa  45.1  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  21.07 
 
 		 491 aa  45.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3027  N-acetylglucosamine-binding protein A  21.32 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.483728 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  29.1 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  29.1 
 
 		 455 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2651  PKD domain-containing protein  39.78 
 
 		 611 aa  43.9  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  28.06 
 
 		 456 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>