86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2047 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A2045  chitin-binding protein  99.73 
 
 
365 aa  747    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.548348  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0669  chitin-binding protein  99.02 
 
 
408 aa  833    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0759  chitin binding domain-containing protein  99.02 
 
 
408 aa  833    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1070  chitin-binding protein  99.21 
 
 
378 aa  774    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1785  chitin binding domain-containing protein  99.73 
 
 
365 aa  747    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.361699  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0777  chitin-binding protein  99.73 
 
 
365 aa  747    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.875326  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1925  chitin binding domain-containing protein  90.65 
 
 
449 aa  716    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2047  chitin binding domain-containing protein  100 
 
 
417 aa  858    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3305  chitin binding domain-containing protein  52.39 
 
 
534 aa  356  5e-97  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000109771  hitchhiker  0.000135909 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3154  chitin binding domain-containing protein  52.39 
 
 
534 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3293  chitin-binding domain-containing protein  52.39 
 
 
534 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.494487  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000907  spindolin-related protein  38.59 
 
 
392 aa  218  1e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.841793  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1137  putative chitinase  38.82 
 
 
402 aa  202  7e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000021802  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2718  chitin-binding domain-containing protein  36.62 
 
 
405 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.279999  hitchhiker  0.00241809 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0217  chitinase B  35.39 
 
 
395 aa  184  3e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02190  hypothetical protein  38.81 
 
 
497 aa  143  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3105  chitin-binding domain-containing protein  35.49 
 
 
276 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.179745 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0257  hypothetical protein  29.33 
 
 
378 aa  113  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2470  chitin-binding domain 3 protein  33.75 
 
 
443 aa  107  5e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242229  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7565  hypothetical protein  31.82 
 
 
359 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7908  hypothetical protein  33.94 
 
 
285 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.921269  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3877  chitin-binding domain 3 protein  30.72 
 
 
390 aa  103  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.770078 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2647  chitin-binding domain-containing protein  32.37 
 
 
307 aa  103  6e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  32.87 
 
 
372 aa  94.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53250  chitin-binding protein CbpD precursor  30.27 
 
 
389 aa  92  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.889986 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3878  chitin-binding domain 3 protein  29.24 
 
 
391 aa  90.1  6e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.785227 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
360 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4667  chitin-binding protein CbpD precursor  31.25 
 
 
388 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.353514  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2948  chitin-binding domain 3 protein  32.87 
 
 
306 aa  88.2  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0411375  hitchhiker  0.000170836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  34.58 
 
 
358 aa  86.7  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4286  chitin-binding domain 3 protein  30.49 
 
 
347 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.074311 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  31.69 
 
 
438 aa  82.4  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0172  chitin-binding domain 3 protein  30.49 
 
 
362 aa  77  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.808366  hitchhiker  0.00471086 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2447  chitin-binding domain 3 protein  30 
 
 
389 aa  75.9  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0284927 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  29.46 
 
 
354 aa  75.9  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1419  N-acetylglucosamine-binding protein A  28.62 
 
 
497 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.28582  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2244  chitin-binding domain 3 protein  27.31 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.620526  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4563  chitin-binding domain 3 protein  34.48 
 
 
212 aa  68.2  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0175  chitin-binding domain 3 protein  26.61 
 
 
400 aa  67.4  0.0000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242955 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0316  chitin-binding domain 3 protein  29.58 
 
 
368 aa  66.2  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.289013  hitchhiker  0.00214449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3518  chitin-binding domain 3 protein  25.52 
 
 
235 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1268  putative secreted cellulose-binding protein  28.09 
 
 
222 aa  63.5  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.459217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1611  chitin-binding domain 3 protein  33.58 
 
 
201 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0398981 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  28.3 
 
 
429 aa  58.9  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1372  chitin-binding domain 3 protein  24.9 
 
 
393 aa  58.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.507673 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  24.05 
 
 
455 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1429  N-acetylglucosamine-binding protein A  22.94 
 
 
486 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  23.27 
 
 
456 aa  56.6  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4693  chitin-binding domain 3 protein  25.96 
 
 
220 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  22.69 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  22.69 
 
 
455 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  22.69 
 
 
455 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  22.83 
 
 
456 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  24.05 
 
 
455 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  23.08 
 
 
455 aa  53.5  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2475  chitin-binding domain 3 protein  26.25 
 
 
223 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2855  chitin binding protein, putative  28.03 
 
 
221 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  23.63 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  23.63 
 
 
455 aa  52.4  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  22.31 
 
 
455 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  23.83 
 
 
455 aa  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2657  chitin-binding domain 3 protein  29.58 
 
 
201 aa  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0896  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.91 
 
 
481 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  22.35 
 
 
455 aa  52.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2455  putative chitin binding protein  27.48 
 
 
221 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3466  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.91 
 
 
481 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.266116  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  25 
 
 
458 aa  50.8  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3589  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.91 
 
 
481 aa  50.8  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  27.34 
 
 
445 aa  50.8  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2838  putative chitin binding protein  26.72 
 
 
221 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3478  chitin-binding domain-containing protein  24.3 
 
 
197 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.499275  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3879  N-acetylglucosamine-binding protein A  24 
 
 
477 aa  48.5  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000531215  unclonable  0.0000000195953 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3390  N-acetylglucosamine-binding protein A  24.42 
 
 
481 aa  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3184  chitin-binding domain 3 protein  28.26 
 
 
197 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0613231  hitchhiker  0.000000000626319 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2636  chitin binding protein  27.13 
 
 
221 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.218903  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2827  chitin binding protein  27.13 
 
 
221 aa  47.8  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2833  putative chitin binding protein  27.13 
 
 
221 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000729775 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2876  putative chitin binding protein  27.13 
 
 
221 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00584171  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2552  chitin-binding protein  27.13 
 
 
221 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2586  chitin-binding protein  27.13 
 
 
221 aa  47.8  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00109431  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1926  chitin-binding domain-containing protein  27.01 
 
 
216 aa  47  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00415605  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  22.6 
 
 
459 aa  46.6  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  22.41 
 
 
458 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0947  N-acetylglucosamine-binding protein A  24 
 
 
491 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.809737  normal  0.0565044 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2627  chitin-binding domain-containing protein  25.95 
 
 
221 aa  45.1  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0865441  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1072  N-acetylglucosamine-binding protein A  23.49 
 
 
491 aa  44.7  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>