250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1918 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1918  hypothetical protein  100 
 
 		 561 aa  1127    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1022  Fibronectin type III domain-containing protein  75.2 
 
 		 492 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.871792  normal  0.307006 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  69.51 
 
 		 514 aa  533  1e-150  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6238  cellulose-binding family II  51.99 
 
 		 552 aa  402  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4408  hypothetical protein  62.07 
 
 		 338 aa  400  9.999999999999999e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2033  glycosyl hydrolase family chitinase  41.58 
 
 		 591 aa  203  5e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.635984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5624  Chitinase  38.31 
 
 		 421 aa  192  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2490  Carbohydrate-binding CenC domain protein  34.24 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  42.72 
 
 		 613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0432  cellulose-binding family II  28.26 
 
 		 562 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.302151 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6988  lysozyme  30.17 
 
 		 539 aa  130  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.14763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1445  Chitinase  31.58 
 
 		 597 aa  127  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.586711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  28.36 
 
 		 623 aa  127  6e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  49.4 
 
 		 743 aa  124  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1643  lysozyme  32.03 
 
 		 451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.197818 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  51.41 
 
 		 973 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4397  hydrolase transmembrane protein  31.49 
 
 		 324 aa  120  6e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.591103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1588  lysozyme  32.86 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.421382  normal  0.415988 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1569  chitinase  32.86 
 
 		 451 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.873549  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1190  chitinase  32.38 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0835249  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1670  chitinase  32.38 
 
 		 451 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0521998  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03689  hydrolase transmembrane protein  31.35 
 
 		 401 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0493131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4818  glycosyl hydrolase family chitinase  31.43 
 
 		 451 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.642032 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0038  chitinase domain-containing protein  29.08 
 
 		 593 aa  112  1.0000000000000001e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0387  sugar hydrolase  29.69 
 
 		 315 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0250299  normal  0.468483 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  34.55 
 
 		 455 aa  111  3e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1021  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  30.98 
 
 		 490 aa  112  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.278615  normal  0.298749 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5623  Lysozyme  29.06 
 
 		 426 aa  111  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.700904  normal  0.234327 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1165  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00309995  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1606  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.508169  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0268  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.224241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  39.23 
 
 		 6885 aa  111  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1962  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 449 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.639701  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0892  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 453 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0799389  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0302  Lysozyme  29.72 
 
 		 507 aa  110  6e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2109  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1946  glycosy hydrolase family protein  30.58 
 
 		 453 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0879  fibronectin type III domain-containing protein  26.65 
 
 		 751 aa  110  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  34.76 
 
 		 455 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  35.08 
 
 		 455 aa  110  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2006  cellulose-binding family II  31.43 
 
 		 1194 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0781083  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2402  glycosy hydrolase family protein  30.14 
 
 		 504 aa  110  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.924859  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2141  chitinase  28.72 
 
 		 665 aa  110  1e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.274855  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  38.73 
 
 		 648 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  39.57 
 
 		 455 aa  107  4e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  40.1 
 
 		 456 aa  107  6e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  34.22 
 
 		 455 aa  107  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  37.43 
 
 		 455 aa  107  8e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  33.69 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  35.29 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  35.29 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  33.69 
 
 		 455 aa  106  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  34.22 
 
 		 455 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4214  glycoside hydrolase family 5  62.77 
 
 		 608 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.303504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1328  Ricin B lectin  27.06 
 
 		 452 aa  104  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.47915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3395  coagulation factor 5/8 type domain protein  40.69 
 
 		 1448 aa  103  7e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.392146  normal  0.950176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4160  glycoside hydrolase family 18  38.8 
 
 		 762 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.299546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  36.6 
 
 		 2170 aa  101  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2169  hypothetical protein  28.72 
 
 		 324 aa  101  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2637  Ricin B lectin  28.24 
 
 		 465 aa  99.4  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.352697  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7591  Chitinase-like protein  41.79 
 
 		 854 aa  97.8  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0192661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  37.8 
 
 		 1887 aa  97.1  8e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3556  Chitinase  26.13 
 
 		 358 aa  96.7  9e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  64.71 
 
 		 1121 aa  95.9  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  34.55 
 
 		 458 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2142  hypothetical protein  27.66 
 
 		 324 aa  94.4  5e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03565  thermolysin  51.04 
 
 		 1154 aa  93.6  8e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0887  Chitinase  26.01 
 
 		 540 aa  93.6  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.413274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  35.56 
 
 		 680 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  36.46 
 
 		 456 aa  92.8  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  65.12 
 
 		 1137 aa  92.4  2e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  40.53 
 
 		 809 aa  92.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0615  glycoside hydrolase family protein  64.71 
 
 		 1209 aa  92  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.435681  hitchhiker  0.00420105 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3505  chitinase, cellulase  27.81 
 
 		 2305 aa  92  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0820772 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0020  Chitinase  28.17 
 
 		 543 aa  92  3e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  decreased coverage  0.00474187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  33.69 
 
 		 458 aa  90.9  5e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4723  endonuclease I  47.27 
 
 		 614 aa  90.1  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3001  chitinase  29.67 
 
 		 2310 aa  90.1  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.426725  normal  0.0460481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3603  cellulose-binding family II  66.27 
 
 		 460 aa  89.7  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.131796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  31.48 
 
 		 459 aa  88.2  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  29.97 
 
 		 703 aa  87  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3216  glycoside hydrolase family 5  56.25 
 
 		 649 aa  87  8e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  36.61 
 
 		 2286 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7134  Chitinase-like protein  77.53 
 
 		 662 aa  84.7  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  49.55 
 
 		 847 aa  84.7  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  28.75 
 
 		 551 aa  84  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3050  fibronectin, type III  36.88 
 
 		 667 aa  84  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000157497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0373  coagulation factor 5/8 type domain protein  57.61 
 
 		 795 aa  83.6  0.000000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.634884  normal  0.96557 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1229  glycosyl hydrolase family chitinase  23.15 
 
 		 393 aa  82.4  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.413268  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1150  glycoside hydrolase family 6  46.55 
 
 		 655 aa  82.8  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0901469  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0883  PKD domain containing protein  26.09 
 
 		 461 aa  82  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00168906  normal  0.17524 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2388  Fibronectin type III domain protein  36.18 
 
 		 768 aa  81.6  0.00000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.52789  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3465  coagulation factor 5/8 type domain protein  38.15 
 
 		 729 aa  80.9  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.552807  hitchhiker  0.00639075 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1601  fibronectin, type III  24.18 
 
 		 548 aa  80.5  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.751366 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2512  cellulose-binding family II protein  42.64 
 
 		 637 aa  80.5  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0886  peptidase M4, thermolysin  52.08 
 
 		 924 aa  80.5  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  30.85 
 
 		 803 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5623  fibronectin type III domain-containing protein  46.51 
 
 		 749 aa  79.7  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.198115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1153  glycoside hydrolase family 48  39.9 
 
 		 900 aa  79.7  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.420841  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0618  cellulose-binding family II protein  63.95 
 
 		 1298 aa  79  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0939482  hitchhiker  0.00792989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>