202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1029 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  100 
 
 		 792 aa  1517    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3028  avirulence protein  37.82 
 
 		 585 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1978  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase  24.4 
 
 		 797 aa  130  9.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0062  alpha-L-arabinofuranosidase B  29.93 
 
 		 854 aa  117  1.0000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.649597  normal  0.531326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1331  putative avirulence protein  28.46 
 
 		 630 aa  97.1  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0814  putative avirulence protein  25.2 
 
 		 621 aa  92  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1043  putative avirulence protein  25.2 
 
 		 622 aa  90.1  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0296  glycoside hydrolase family protein  32.08 
 
 		 846 aa  87  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0925  cellulose-binding family II  41.67 
 
 		 460 aa  83.6  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.146256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0538  glycoside hydrolase family 6  43.04 
 
 		 446 aa  82.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.448554 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4194  1, 4-beta cellobiohydrolase  42.71 
 
 		 437 aa  81.3  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.28585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4152  cellulose-binding family II  41 
 
 		 449 aa  80.1  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2633  PHB depolymerase family esterase  40.91 
 
 		 422 aa  80.5  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.655829 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1572  cellulose-binding family II  42.71 
 
 		 702 aa  79  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280577  hitchhiker  0.00883315 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2229  glycoside hydrolase family 5  37.86 
 
 		 468 aa  78.2  0.0000000000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3462  cellulose-binding family II protein  38.24 
 
 		 773 aa  77  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0281342  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2139  family 10 glycoside hydrolase  39.77 
 
 		 474 aa  77  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1612  cellulose-binding family II protein  43.21 
 
 		 925 aa  76.3  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8280  cellulase  45.88 
 
 		 851 aa  75.9  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.396487  normal  0.103069 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2990  cellulose-binding family II protein  41.75 
 
 		 366 aa  75.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.826139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0935  hypothetical protein  34.48 
 
 		 847 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.619972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1868  cellulose-binding family II  38.61 
 
 		 744 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3222  cellulose-binding family II  44.44 
 
 		 673 aa  75.1  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1559  family 62 glycoside hydrolase  39.39 
 
 		 488 aa  75.1  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.622478  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2022  cellulose-binding family II  39.08 
 
 		 743 aa  74.3  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.12733 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3461  cellulose-binding family II protein  38.24 
 
 		 486 aa  74.3  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1330  putative avirulence protein  27.54 
 
 		 618 aa  73.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1074  endoglucanase  37.37 
 
 		 441 aa  73.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0857507  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1040  chitin-binding domain 3 protein  37.76 
 
 		 372 aa  71.6  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0290504 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3959  esterase, PHB depolymerase family  44.57 
 
 		 423 aa  71.2  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2646  glycoside hydrolase family protein  30.22 
 
 		 812 aa  71.2  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00270036  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0900  mannan endo-1,4-beta-mannosidase  40.86 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.716591  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3301  glycoside hydrolase family 62  37.93 
 
 		 485 aa  70.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0111017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0352  family 12 glycoside hydrolase  39.22 
 
 		 393 aa  70.5  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2781  glycoside hydrolase family 5  37.93 
 
 		 681 aa  70.9  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.183868  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5072  Endo-1,4-beta-xylanase  40.21 
 
 		 451 aa  70.5  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0474  glycoside hydrolase family 11  42.68 
 
 		 494 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0285071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3146  glycoside hydrolase family 6  39.24 
 
 		 459 aa  69.7  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2009  cellulose-binding family II protein  39.58 
 
 		 669 aa  69.7  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.872108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1666  cellulose-binding family II protein  34.23 
 
 		 455 aa  70.1  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000449243  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1791  cellulose-binding family II  36.56 
 
 		 913 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.381117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2446  chitin-binding domain 3 protein  37.11 
 
 		 354 aa  69.7  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1219  cellulose-binding family II  43.14 
 
 		 911 aa  68.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0349548 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2656  family 6 glycoside hydrolase  38.64 
 
 		 611 aa  68.9  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2811  glycoside hydrolase family 5  43.21 
 
 		 478 aa  68.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.684544  normal  0.0568731 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0242  cellulose-binding family II  35.92 
 
 		 447 aa  68.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1665  cellulose-binding family II protein  38.46 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.862652  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2447  glycoside hydrolase family 10  36.36 
 
 		 477 aa  68.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2509  esterase, PHB depolymerase family  41.11 
 
 		 489 aa  68.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.821888  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1897  glycoside hydrolase family 5  41.38 
 
 		 597 aa  68.2  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.754177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4174  serine/threonine protein kinase  31.4 
 
 		 493 aa  68.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0993859  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4516  cellulose-binding family II  35.05 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0447786  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0614  glycoside hydrolase family protein  39.18 
 
 		 562 aa  67.8  0.0000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0151906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5719  hypothetical protein  41 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3435  glycoside hydrolase family 9  35.14 
 
 		 794 aa  66.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.019722  normal  0.0493729 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2199  hypothetical protein  22.87 
 
 		 442 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0733  glycoside hydrolase family 10  43.33 
 
 		 488 aa  66.6  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0159525  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2912  1, 4-beta cellobiohydrolase  37.36 
 
 		 491 aa  65.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.426935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0294  cellulose-binding family II protein  27.97 
 
 		 609 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.558691  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4805  glycoside hydrolase family protein  32.26 
 
 		 628 aa  65.9  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1627  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  37.62 
 
 		 998 aa  65.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.234171  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3043  cellulose-binding family II  34.12 
 
 		 774 aa  65.5  0.000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0905  glycoside hydrolase family 10  35.56 
 
 		 690 aa  65.1  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.506442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2372  cellulose-binding family II protein  32.58 
 
 		 842 aa  65.1  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1822  chitin-binding domain 3 protein  39.33 
 
 		 429 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309738  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5339  glycoside hydrolase family 9  38.1 
 
 		 875 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2729  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  33.33 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.400956  normal  0.406938 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3263  chitin-binding domain-containing protein  40.4 
 
 		 358 aa  64.3  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.175629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1830  glycoside hydrolase family 5  37.63 
 
 		 543 aa  64.3  0.000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3105  glycoside hydrolase family 48  35.56 
 
 		 854 aa  64.3  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0252708  hitchhiker  0.000502295 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  31.87 
 
 		 1055 aa  63.5  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0780  PHB depolymerase family esterase  36.36 
 
 		 436 aa  63.9  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2913  1, 4-beta cellobiohydrolase  36.36 
 
 		 469 aa  63.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.489381  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2792  cellulose-binding family II  43.9 
 
 		 681 aa  63.9  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1896  1, 4-beta cellobiohydrolase  34.44 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.776414 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4682  cellulose-binding family II  36.78 
 
 		 593 aa  63.2  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2138  family 48 glycoside hydrolase  34.41 
 
 		 785 aa  63.2  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.497206  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0620  cellobiohydrolase  31.68 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.250178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6407  Cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  37.04 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0259803 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3037  chitin-binding domain-containing protein  38 
 
 		 360 aa  62.4  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.245182  normal  0.198398 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2728  Alpha-L-arabinofuranosidase B catalytic  35.11 
 
 		 499 aa  62.4  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0684443  normal  0.907122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  33.67 
 
 		 743 aa  62  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0923  cellulose-binding family II  35.48 
 
 		 746 aa  62  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0984309 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2449  1, 4-beta cellobiohydrolase  32.67 
 
 		 590 aa  62  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1182  hypothetical protein  29.52 
 
 		 371 aa  62  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.104267 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3169  cellulose-binding family II  40 
 
 		 545 aa  62  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.111807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3120  cellulose-binding family II  33.66 
 
 		 439 aa  62  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0893071  hitchhiker  0.00025616 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3168  cellulose-binding family II  39.24 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0614934 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4558  glycoside hydrolase family 9  38.64 
 
 		 864 aa  61.2  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.213075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4414  glycoside hydrolase family 10  40 
 
 		 487 aa  61.2  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3420  thiamine-monophosphate kinase  32 
 
 		 725 aa  61.2  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0210167 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0071  hexapaptide repeat-containing transferase  37 
 
 		 147 aa  61.2  0.00000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2136  glycoside hydrolase family protein  32.32 
 
 		 1128 aa  61.2  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8171  endo-chitinase, putative, chi18D  35.87 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.714461 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0936  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  32.08 
 
 		 979 aa  61.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3983  glycoside hydrolase family protein  35.16 
 
 		 589 aa  60.8  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.000432599  normal  0.0119912 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1183  peptide chain release factor 2  30.48 
 
 		 1042 aa  60.5  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.975079  normal  0.154806 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4957  cellulose-binding family II  35 
 
 		 688 aa  60.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0505986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6890  cellobiohydrolase A (1 4-beta-cellobiosidase A)- like protein  31.68 
 
 		 767 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2167  glycoside hydrolase family 48  36.25 
 
 		 974 aa  60.5  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185965  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>