28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0062 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0062  alpha-L-arabinofuranosidase B  100 
 
 		 854 aa  1748    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.649597  normal  0.531326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1330  putative avirulence protein  49.58 
 
 		 618 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0814  putative avirulence protein  48.75 
 
 		 621 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1043  putative avirulence protein  47.67 
 
 		 622 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1331  putative avirulence protein  43.45 
 
 		 630 aa  472  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3028  avirulence protein  33.01 
 
 		 585 aa  181  5.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577081  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1978  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase  26.25 
 
 		 797 aa  160  8e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2139  alpha-L-arabinofuranosidase B  36.49 
 
 		 982 aa  125  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  48.46 
 
 		 707 aa  125  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2138  glycoside hydrolase family protein  44.2 
 
 		 580 aa  111  6e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1971  alpha-L-arabinofuranosidase B  46.21 
 
 		 478 aa  102  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000055654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  29.79 
 
 		 792 aa  86.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1273  alpha-L-arabinofuranosidase B  37.06 
 
 		 481 aa  85.9  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2199  hypothetical protein  26.22 
 
 		 442 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1872  alpha-L-arabinofuranosidase B  35.71 
 
 		 980 aa  60.1  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1858  Alpha-N-arabinofuranosidase  34.13 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0836  hypothetical protein  41.24 
 
 		 268 aa  55.8  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000351202 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01571  Alpha-L-arabinofuranosidasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O74288]  30.06 
 
 		 510 aa  51.6  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.611829 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38966  predicted protein  39.67 
 
 		 555 aa  50.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00578111  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5160  Xylan 1,4-beta-xylosidase  34.44 
 
 		 519 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0027116 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1469  heat shock protein DnaJ domain-containing protein  54.24 
 
 		 445 aa  49.3  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0854841  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0874  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1489 aa  48.9  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  59.46 
 
 		 764 aa  47.8  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  43.62 
 
 		 551 aa  47.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  42.22 
 
 		 840 aa  47.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1873  peptidoglycan binding domain-containing protein  38.64 
 
 		 261 aa  45.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.499146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4504  PT repeat-containing protein  48.81 
 
 		 456 aa  45.4  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  43.75 
 
 		 1217 aa  44.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>