26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1978 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_1978  N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase  100 
 
 		 797 aa  1655    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.752482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3028  avirulence protein  32.69 
 
 		 585 aa  290  5.0000000000000004e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.577081  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0814  putative avirulence protein  27.5 
 
 		 621 aa  169  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1043  putative avirulence protein  26.79 
 
 		 622 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0062  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.67 
 
 		 854 aa  160  8e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.649597  normal  0.531326 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1330  putative avirulence protein  27.38 
 
 		 618 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1331  putative avirulence protein  24.52 
 
 		 630 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2199  hypothetical protein  26.69 
 
 		 442 aa  128  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.39349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1029  cellulose-binding family II  23.53 
 
 		 792 aa  108  6e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.746729 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  47.95 
 
 		 750 aa  61.2  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  40.23 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  37.93 
 
 		 446 aa  57.4  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  43.75 
 
 		 446 aa  56.2  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  38.71 
 
 		 1027 aa  55.1  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1336  endoglucanase-like protein  34.33 
 
 		 978 aa  52.8  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.557457  normal  0.0374623 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  37.66 
 
 		 864 aa  50.8  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  48.05 
 
 		 456 aa  50.1  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0352  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  36.23 
 
 		 665 aa  49.7  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.259474  normal  0.181219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  47.46 
 
 		 1081 aa  47.8  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1408  alpha amylase, catalytic region  39.06 
 
 		 957 aa  46.2  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1858  hypothetical protein  32.95 
 
 		 888 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276956 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  35.38 
 
 		 2082 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.89 
 
 		 797 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  34.19 
 
 		 835 aa  44.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.51 
 
 		 726 aa  44.3  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3245  hypothetical protein  34.78 
 
 		 537 aa  44.3  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>