48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0968 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  100 
 
 		 456 aa  907    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  47.84 
 
 		 1004 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  44.68 
 
 		 845 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  37.69 
 
 		 940 aa  136  8e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  43.98 
 
 		 4357 aa  127  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  37.84 
 
 		 841 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  42.19 
 
 		 720 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  46.75 
 
 		 1263 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0368  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.26 
 
 		 1453 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.120671 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3414  Kelch repeat-containing protein  31.64 
 
 		 1407 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  37.5 
 
 		 331 aa  110  6e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0305  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.5 
 
 		 1451 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  36.5 
 
 		 1027 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0537  Kelch repeat-containing protein  38.59 
 
 		 1514 aa  102  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  41.83 
 
 		 864 aa  100  4e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  34.67 
 
 		 2082 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  37.79 
 
 		 835 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  40 
 
 		 1390 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  37.23 
 
 		 321 aa  87.4  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  40.26 
 
 		 1081 aa  86.3  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.15 
 
 		 726 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  36.41 
 
 		 2002 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3237  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.53 
 
 		 1512 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.62 
 
 		 1323 aa  84  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  29.59 
 
 		 2117 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  31.95 
 
 		 446 aa  73.2  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  33.53 
 
 		 432 aa  70.9  0.00000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  32.09 
 
 		 446 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  38.32 
 
 		 1222 aa  67  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.67 
 
 		 607 aa  66.6  0.0000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  32.39 
 
 		 1095 aa  65.1  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  34.55 
 
 		 998 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  28.95 
 
 		 514 aa  64.7  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  38.6 
 
 		 1076 aa  64.3  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  27.27 
 
 		 582 aa  64.3  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  39.18 
 
 		 708 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3239  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  33.96 
 
 		 1535 aa  61.6  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3805  PKD domain-containing protein  35.25 
 
 		 917 aa  61.2  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0227113  normal  0.200491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  29.52 
 
 		 608 aa  53.9  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  37.82 
 
 		 792 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1872  hypothetical protein  34.3 
 
 		 848 aa  50.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0860464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  27.37 
 
 		 531 aa  50.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3245  hypothetical protein  25.76 
 
 		 537 aa  50.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  44.05 
 
 		 839 aa  50.1  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  44.44 
 
 		 665 aa  47.4  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.47 
 
 		 489 aa  46.6  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0376  hypothetical protein  41.76 
 
 		 870 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1145  hypothetical protein  25.26 
 
 		 716 aa  43.9  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>