65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_5637 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_5637  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  100 
 
 
489 aa  976    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7345  hypothetical protein  47.94 
 
 
531 aa  406  1.0000000000000001e-112  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617386  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1644  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.12 
 
 
519 aa  273  6e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.436987 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1868  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  39.03 
 
 
304 aa  166  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.148816  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  35.69 
 
 
321 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.49777  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9183  hypothetical protein  38.58 
 
 
350 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36.59 
 
 
279 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3187  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  36 
 
 
289 aa  121  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.280318  normal  0.0143084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1440  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  37.24 
 
 
280 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0855011  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3458  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  32.76 
 
 
687 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.149528  normal  0.571411 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29530  uncharacterized AP superfamily protein  37.13 
 
 
287 aa  109  1e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3195  hemopexin repeat-containing protein  36.26 
 
 
262 aa  105  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.000696311  hitchhiker  0.000000000670294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3392  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  29.52 
 
 
414 aa  99.4  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.595047  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0975  hypothetical protein  31.58 
 
 
416 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0968  hypothetical protein  29.89 
 
 
413 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3216  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.57 
 
 
629 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6200  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.74 
 
 
413 aa  91.3  4e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1007  hypothetical protein  29 
 
 
394 aa  90.5  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.764535  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6789  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.01 
 
 
415 aa  89  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0417562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1785  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  31.6 
 
 
574 aa  80.5  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  27.2 
 
 
1967 aa  70.5  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4286  hypothetical protein  28.12 
 
 
678 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.119503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1217  Nucleotide diphosphatase  27.35 
 
 
417 aa  68.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.446386  normal  0.0486309 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1244  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.93 
 
 
262 aa  67.4  0.0000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0400  Phosphodiesterase I  27.93 
 
 
422 aa  66.2  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0422651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2638  hypothetical protein  27.24 
 
 
676 aa  62.8  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.828392  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1878  phosphodiesterase I  24.71 
 
 
428 aa  60.5  0.00000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.872565 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1707  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.77 
 
 
307 aa  59.7  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0947462  hitchhiker  4.53263e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0836  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.57 
 
 
499 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2615  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.09 
 
 
499 aa  57  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000242867  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3048  hypothetical protein  26.09 
 
 
676 aa  57  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.489525  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7531  hypothetical protein  27.18 
 
 
706 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.691275  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1181  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.25 
 
 
478 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0227784  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  24.5 
 
 
569 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0747  hypothetical protein  24.36 
 
 
274 aa  53.5  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1658  nucleotide diphosphatase  27.61 
 
 
413 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.752707 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03452  putative type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase protein  24.9 
 
 
447 aa  52.8  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0661  hypothetical protein  23.75 
 
 
695 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.639772 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1106  phosphodiesterase I  24.14 
 
 
424 aa  51.6  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0726  hypothetical protein  25.28 
 
 
274 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2969  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.75 
 
 
558 aa  50.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00836901  hitchhiker  0.00161075 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1841  phosphodiesterase I  30.23 
 
 
400 aa  50.1  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.126105  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2169  phosphodiesterase I  26 
 
 
433 aa  48.9  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6162  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  22.18 
 
 
433 aa  49.3  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0270594 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07550  nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase family member (Eurofung)  20.96 
 
 
713 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.934935  decreased coverage  0.0000816404 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04783  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  26.7 
 
 
384 aa  48.5  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.256465  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0126  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase family protein  21.69 
 
 
411 aa  47.4  0.0005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000372693 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2080  phosphodiesterase I  24.75 
 
 
433 aa  47.4  0.0006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1550  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.5 
 
 
385 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0842703  normal  0.0911762 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0170  hypothetical protein  25.57 
 
 
402 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.305358  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06496  transferase (Gpi7), putative (AFU_orthologue; AFUA_6G05260)  25.43 
 
 
847 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.000895802 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2806  hypothetical protein  32.22 
 
 
665 aa  46.2  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1104  hypothetical protein  25.48 
 
 
267 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_70997  phosphodiesterase; putative nucleotide pyrophosphatase precursor  21.4 
 
 
709 aa  45.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.42018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3994  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.17 
 
 
273 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.236352  normal  0.332421 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1725  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.17 
 
 
278 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0109136 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2675  hypothetical protein  30.12 
 
 
665 aa  44.7  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1317  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.72 
 
 
268 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.807022 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1567  sulfatase  33.86 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0183451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2382  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.1 
 
 
389 aa  44.3  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.173924 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3829  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  24.11 
 
 
312 aa  44.3  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.750718  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1497  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  30.1 
 
 
558 aa  43.9  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0276487 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20320  uncharacterized AP superfamily protein  34.55 
 
 
427 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.291938  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5338  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  34.88 
 
 
509 aa  43.1  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.935168 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1274  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  23.85 
 
 
268 aa  43.1  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.303048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>