28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1857 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  35.39 
 
 		 331 aa  98.6  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  36.57 
 
 		 720 aa  96.7  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  31.98 
 
 		 2117 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  37.23 
 
 		 456 aa  86.3  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  36.77 
 
 		 864 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  32.51 
 
 		 835 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.13 
 
 		 726 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  29.65 
 
 		 845 aa  73.2  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  35.59 
 
 		 1095 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  36.47 
 
 		 2002 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  40.74 
 
 		 940 aa  65.5  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  35.06 
 
 		 841 aa  60.1  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.63 
 
 		 1323 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  39.51 
 
 		 4357 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  33.11 
 
 		 998 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  31.07 
 
 		 608 aa  55.8  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  25.77 
 
 		 582 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  38.24 
 
 		 1222 aa  55.1  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  42.25 
 
 		 1263 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  30.67 
 
 		 514 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  32.47 
 
 		 1081 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  30.69 
 
 		 607 aa  50.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  31.07 
 
 		 1027 aa  48.9  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  40 
 
 		 1076 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  30.46 
 
 		 1004 aa  47.4  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  47.54 
 
 		 1390 aa  46.6  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  32.31 
 
 		 708 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>