40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1454 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  100 
 
 		 1095 aa  2143    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  32.2 
 
 		 1081 aa  350  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  36.02 
 
 		 720 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  32.02 
 
 		 2117 aa  79.3  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  37.97 
 
 		 940 aa  79  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  33.92 
 
 		 331 aa  72  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  36.16 
 
 		 2002 aa  71.2  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.57 
 
 		 726 aa  70.1  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  31.11 
 
 		 1027 aa  65.1  0.000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  51.28 
 
 		 1263 aa  65.1  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  32.32 
 
 		 4357 aa  64.3  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  32.54 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  34.44 
 
 		 321 aa  62.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  35.29 
 
 		 835 aa  62  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.59 
 
 		 1323 aa  61.6  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  31.36 
 
 		 608 aa  60.1  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  50 
 
 		 2042 aa  59.7  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  31.07 
 
 		 845 aa  58.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  33.12 
 
 		 998 aa  58.5  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2915  cell wall/surface repeat protein  39.58 
 
 		 1310 aa  56.6  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5222  hypothetical protein  43.75 
 
 		 386 aa  56.2  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  41.84 
 
 		 456 aa  55.8  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3003  Outer membrane autotransporter barrel  30.49 
 
 		 1695 aa  55.5  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.277946 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  36.76 
 
 		 1848 aa  55.1  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  36.05 
 
 		 665 aa  54.7  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4229  FG-GAP repeat protein  42.47 
 
 		 1527 aa  54.3  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.460586  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2341  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  38.46 
 
 		 757 aa  54.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.480473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  33.73 
 
 		 708 aa  53.5  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  51.9 
 
 		 1394 aa  52.8  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.73 
 
 		 1673 aa  52.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  32.82 
 
 		 1390 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  51.79 
 
 		 1076 aa  51.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  41.84 
 
 		 2082 aa  51.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  28.57 
 
 		 582 aa  50.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  62.5 
 
 		 792 aa  49.7  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  34.81 
 
 		 864 aa  49.7  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  32.02 
 
 		 841 aa  48.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  28.42 
 
 		 607 aa  47.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2914  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  27.56 
 
 		 1035 aa  46.6  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3346  hypothetical protein  37.35 
 
 		 300 aa  46.2  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.605131  normal  0.0139562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>