37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1457 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  100 
 
 
940 aa  1863    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  36.78 
 
 
456 aa  156  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  45.14 
 
 
1027 aa  147  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  45.51 
 
 
331 aa  145  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  44.27 
 
 
998 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  38.96 
 
 
1390 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  43.59 
 
 
4357 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  45.62 
 
 
1263 aa  115  5e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.57 
 
 
1323 aa  114  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  39.8 
 
 
2002 aa  111  7.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2586  hypothetical protein  46.05 
 
 
582 aa  106  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0849456  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  38.24 
 
 
845 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  38.69 
 
 
2117 aa  104  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  45.89 
 
 
1081 aa  97.8  9e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  38.86 
 
 
841 aa  97.1  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  37.1 
 
 
720 aa  95.5  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  38.24 
 
 
1095 aa  94.7  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1458  M6 family metalloprotease domain protein  39.9 
 
 
1004 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000451067  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.44 
 
 
726 aa  92  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  41.03 
 
 
864 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1456  hypothetical protein  46.05 
 
 
792 aa  84.3  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.158395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  33.7 
 
 
2082 aa  83.2  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  35.67 
 
 
321 aa  83.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  34.21 
 
 
514 aa  81.3  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  34.22 
 
 
835 aa  78.2  0.0000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  35.39 
 
 
608 aa  75.5  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  34.39 
 
 
1076 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.07 
 
 
607 aa  71.2  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  45.68 
 
 
1222 aa  62.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  51.22 
 
 
665 aa  62  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  33.33 
 
 
708 aa  61.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1367  cell wall/surface repeat-containing protein  33.56 
 
 
432 aa  55.8  0.000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1621  hypothetical protein  27.95 
 
 
446 aa  53.1  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.967511  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0891  subtilase domain-containing protein  45 
 
 
826 aa  52.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1217  metalloprotease, putative  45.57 
 
 
839 aa  48.5  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000727805  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0079  cell wall/surface repeat protein  48.1 
 
 
750 aa  48.5  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1503  cell wall/surface repeat protein  27.66 
 
 
446 aa  47  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>