49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1844 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 720 aa  1437    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  39.87 
 
 		 744 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  39.14 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  36.33 
 
 		 448 aa  215  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  39.14 
 
 		 442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  35.86 
 
 		 743 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  36.05 
 
 		 755 aa  209  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  36.77 
 
 		 743 aa  207  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  39.4 
 
 		 442 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475341 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  37.31 
 
 		 442 aa  204  6e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  36.62 
 
 		 743 aa  197  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  31.71 
 
 		 825 aa  176  1.9999999999999998e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  31.73 
 
 		 448 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  33.26 
 
 		 841 aa  137  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  27.41 
 
 		 836 aa  127  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1453  hypothetical protein  38.69 
 
 		 331 aa  105  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0968  hypothetical protein  40.1 
 
 		 456 aa  103  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  29.06 
 
 		 470 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1454  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  36.02 
 
 		 1095 aa  98.2  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000744178  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1858  IPT/TIG domain-containing protein  37.79 
 
 		 1081 aa  95.5  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0239021  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2340  peptidase C10 streptopain  37.43 
 
 		 845 aa  92.4  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2339  APHP domain protein  38.55 
 
 		 2002 aa  91.7  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  28.76 
 
 		 467 aa  91.3  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1857  hypothetical protein  37.14 
 
 		 321 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000442866  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1457  hypothetical protein  37.41 
 
 		 940 aa  78.2  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000415379  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2109  Spore coat protein CotH  35.19 
 
 		 835 aa  77  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00013644  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1721  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.07 
 
 		 1323 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00699469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  33.72 
 
 		 2117 aa  74.3  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2338  peptidase C10 streptopain  35.47 
 
 		 841 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.193161  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3010  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.36 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  29.76 
 
 		 4357 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2890  hypothetical protein  32.65 
 
 		 514 aa  62.4  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.921469  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3066  hypothetical protein  42.22 
 
 		 3925 aa  62  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.455665 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3722  hypothetical protein  43.24 
 
 		 1390 aa  61.2  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.645287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2715  fibronectin type III domain-containing protein  35.44 
 
 		 864 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1680  cell wall/surface repeat-containing protein  51.43 
 
 		 1263 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.513356  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1922  regulator of chromosome condensation RCC1  37.5 
 
 		 1222 aa  57  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00199148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2720  hypothetical protein  42.35 
 
 		 665 aa  56.2  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.666755  normal  0.214066 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2051  hypothetical protein  42.67 
 
 		 1076 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.890498  normal  0.473227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3832  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  31.41 
 
 		 607 aa  56.6  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000619199  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1251  BNR repeat-containing protein  40.86 
 
 		 2082 aa  52.4  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2465  hypothetical protein  32.37 
 
 		 608 aa  52.4  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1455  M6 family metalloprotease domain protein  26.98 
 
 		 998 aa  51.2  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00413675  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1377  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  38.03 
 
 		 535 aa  48.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4371  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  38.16 
 
 		 561 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.0000000045691  normal  0.581959 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5246  hypothetical protein  33.71 
 
 		 708 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.733129 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1449  hypothetical protein  31.18 
 
 		 1027 aa  45.1  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.415976  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5438  cell surface receptor IPT/TIG domain protein  40 
 
 		 561 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.904053 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0742  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  29.25 
 
 		 1355 aa  43.9  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>