17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_2367 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  886    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  87.1 
 
 
442 aa  759    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  96.61 
 
 
442 aa  824    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0475341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  886    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  66.67 
 
 
448 aa  600  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  46.48 
 
 
743 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  44.49 
 
 
743 aa  347  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  44.71 
 
 
755 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  44.84 
 
 
743 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  45.12 
 
 
744 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  39.37 
 
 
720 aa  230  5e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  31.93 
 
 
836 aa  127  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  33.16 
 
 
825 aa  126  7e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  33.16 
 
 
448 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  36.1 
 
 
841 aa  118  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  29.07 
 
 
467 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  28.63 
 
 
470 aa  89.7  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>