17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3667 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  100 
 
 		 448 aa  886    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  51.16 
 
 		 467 aa  392  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  46.06 
 
 		 470 aa  353  4e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  39.26 
 
 		 825 aa  238  1e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  39.36 
 
 		 836 aa  219  5e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  37.61 
 
 		 841 aa  196  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  31.73 
 
 		 720 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  33.33 
 
 		 743 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  32.21 
 
 		 743 aa  117  5e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  33.33 
 
 		 743 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  32.81 
 
 		 755 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  31.94 
 
 		 744 aa  108  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  33.16 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  33.16 
 
 		 442 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  29.04 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  30.25 
 
 		 442 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  32.38 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>