74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2202 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 		 841 aa  1654    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  41.71 
 
 		 836 aa  511  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  36.93 
 
 		 825 aa  405  1e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  38.21 
 
 		 467 aa  207  6e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  40.45 
 
 		 448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  37.91 
 
 		 470 aa  197  5.000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  36.9 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  33.26 
 
 		 720 aa  156  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  34.16 
 
 		 743 aa  151  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  33.33 
 
 		 755 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  35.95 
 
 		 743 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  37.27 
 
 		 743 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  34.68 
 
 		 744 aa  132  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  36.36 
 
 		 442 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  36.36 
 
 		 442 aa  127  9e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  32.41 
 
 		 442 aa  124  5e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  35.82 
 
 		 442 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475341 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.56 
 
 		 480 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  29.03 
 
 		 3507 aa  108  6e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  35.67 
 
 		 1363 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  33.53 
 
 		 1380 aa  98.2  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  32.47 
 
 		 670 aa  96.7  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  34.04 
 
 		 1363 aa  95.1  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  29.06 
 
 		 1462 aa  85.5  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  34.27 
 
 		 1973 aa  84.3  0.000000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  31.94 
 
 		 2170 aa  82.4  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  26.02 
 
 		 6885 aa  77  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  26.82 
 
 		 2068 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 4433 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  27.27 
 
 		 1042 aa  68.9  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  27.27 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  27.23 
 
 		 1628 aa  67.8  0.0000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  35.92 
 
 		 1299 aa  67.4  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  25.46 
 
 		 527 aa  65.9  0.000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.61 
 
 		 9585 aa  65.5  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  45.68 
 
 		 340 aa  63.9  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  30.6 
 
 		 1299 aa  63.5  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  41.67 
 
 		 2334 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  25.08 
 
 		 771 aa  60.1  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  29.24 
 
 		 680 aa  59.7  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  26.3 
 
 		 861 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  34.02 
 
 		 995 aa  53.9  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  35.29 
 
 		 999 aa  53.9  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  31.96 
 
 		 1160 aa  53.9  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  28.89 
 
 		 743 aa  53.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  36.61 
 
 		 409 aa  53.1  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  28.43 
 
 		 207 aa  52  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  29.44 
 
 		 692 aa  52  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25.57 
 
 		 2286 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  27.61 
 
 		 1172 aa  49.3  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1240  Glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  32.52 
 
 		 809 aa  48.9  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167459 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  29.17 
 
 		 782 aa  47.8  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  26.46 
 
 		 1430 aa  47.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1701  glycoside hydrolase family protein  43.82 
 
 		 1137 aa  47.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102428 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2466  fibronectin type III domain-containing protein  30.05 
 
 		 1887 aa  47  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.401987  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2169  chitin-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 455 aa  47  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.102093  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0617  glycoside hydrolase family protein  40.48 
 
 		 1121 aa  46.6  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0413787  hitchhiker  0.00805779 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  26.34 
 
 		 455 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3540  hypothetical protein  32.67 
 
 		 1289 aa  46.2  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  25.57 
 
 		 458 aa  45.4  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1917  Chitinase-like protein  35.11 
 
 		 613 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  27.17 
 
 		 455 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  27.17 
 
 		 455 aa  45.4  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  32.47 
 
 		 490 aa  45.4  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  33.51 
 
 		 648 aa  45.4  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  25.88 
 
 		 1735 aa  45.4  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  26.52 
 
 		 456 aa  45.1  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2708  cellulose-binding family II  36.71 
 
 		 514 aa  45.1  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.494794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.86 
 
 		 3802 aa  44.7  0.007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  23.71 
 
 		 455 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0542  glycoside hydrolase family 18  30 
 
 		 703 aa  44.3  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218928  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1712  chitin-binding domain protein  26.37 
 
 		 458 aa  44.3  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000111699 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  30 
 
 		 803 aa  44.3  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  26.37 
 
 		 455 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>