17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2952 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  87.1 
 
 		 442 aa  759    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  100 
 
 		 442 aa  883    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  87.33 
 
 		 442 aa  744    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475341 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  87.1 
 
 		 442 aa  759    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  67.56 
 
 		 448 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  45.37 
 
 		 743 aa  349  7e-95  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  45.35 
 
 		 744 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  43.64 
 
 		 743 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  44.08 
 
 		 755 aa  332  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  43.54 
 
 		 743 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  37.1 
 
 		 720 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  29.65 
 
 		 825 aa  130  7.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  30.7 
 
 		 836 aa  121  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  31.43 
 
 		 448 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  34.18 
 
 		 841 aa  114  5e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  29.19 
 
 		 467 aa  103  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  27.82 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>