17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2629 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  939    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  45.55 
 
 		 448 aa  345  8.999999999999999e-94  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  42.44 
 
 		 467 aa  319  7e-86  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  35.31 
 
 		 825 aa  218  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  37.97 
 
 		 836 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  37.79 
 
 		 841 aa  188  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  31.15 
 
 		 743 aa  121  3e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  29.06 
 
 		 720 aa  114  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  29.33 
 
 		 743 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  28.17 
 
 		 743 aa  107  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  27.99 
 
 		 755 aa  106  8e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  27.65 
 
 		 744 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  29.32 
 
 		 448 aa  98.2  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  28.63 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  27.82 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  28.63 
 
 		 442 aa  89  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  28.83 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475341 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>