84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2953 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_2953  hypothetical protein  100 
 
 
743 aa  1470    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.143577  normal  0.387035 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3397  hypothetical protein  86.54 
 
 
755 aa  1165    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.748182 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1998  hypothetical protein  68.55 
 
 
744 aa  963    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.160392  normal  0.0317231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2552  hypothetical protein  85.2 
 
 
743 aa  1170    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0439698 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2366  hypothetical protein  86.27 
 
 
743 aa  1196    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1999  hypothetical protein  49.66 
 
 
448 aa  376  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.71064  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3396  hypothetical protein  46.48 
 
 
442 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378832  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2367  hypothetical protein  46.48 
 
 
442 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.390039  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2952  hypothetical protein  45.37 
 
 
442 aa  330  4e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302716  normal  0.304759 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2553  hypothetical protein  45.81 
 
 
442 aa  329  9e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0475341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1844  IPT/TIG domain-containing protein  35.86 
 
 
720 aa  210  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.138622  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  31.12 
 
 
825 aa  157  7e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3184  hypothetical protein  48.48 
 
 
1131 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2665  multicopper oxidase type 2  46.46 
 
 
1131 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.717674 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2532  multicopper oxidase, type 2  46.97 
 
 
1131 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  29.28 
 
 
836 aa  140  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  35.14 
 
 
841 aa  119  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2201  hypothetical protein  30.42 
 
 
467 aa  118  5e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.283056 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3667  IPT/TIG domain-containing protein  32.21 
 
 
448 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2629  hypothetical protein  27.31 
 
 
470 aa  93.6  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0105  VCBS  32.96 
 
 
1597 aa  88.6  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.00289742  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0798  hypothetical protein  33.92 
 
 
3474 aa  78.2  0.0000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20050  hypothetical protein  36.82 
 
 
721 aa  77.8  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.127306  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3470  hemolysin-type calcium-binding region  30.91 
 
 
9867 aa  72  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0949  fibronectin, type III domain-containing protein  36.59 
 
 
892 aa  70.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4855  YVTN beta-propeller repeat-containing protein  34 
 
 
2114 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.656621  normal  0.707732 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000465  fibronectin type III domain protein  32.33 
 
 
2839 aa  69.3  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3323  hypothetical protein  34.31 
 
 
3477 aa  67  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00195201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1702  hypothetical protein  34.51 
 
 
1512 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3623  outer membrane adhesin like protein  37.63 
 
 
5745 aa  67.4  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000322965 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3686  parallel beta-helix repeat-containing protein  34.08 
 
 
1066 aa  66.2  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.346515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0506  putative outer membrane adhesin like protein  32.49 
 
 
2816 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1152  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.82 
 
 
3363 aa  65.1  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3182  hypothetical protein  32.52 
 
 
1416 aa  65.1  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  34.74 
 
 
4978 aa  64.3  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3161  outer membrane adhesin-like protein  37.69 
 
 
1269 aa  60.8  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3063  VCBS  34.07 
 
 
1269 aa  60.1  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2554  proprotein convertase, P  35.41 
 
 
1363 aa  60.1  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0166  putative outer membrane adhesin like proteiin  30.6 
 
 
3699 aa  59.7  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1752  proprotein convertase, P  33.33 
 
 
1367 aa  60.1  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3369  hypothetical protein  29.28 
 
 
722 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  31.69 
 
 
3699 aa  58.5  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  31.69 
 
 
2503 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3051  hypothetical protein  34.19 
 
 
1744 aa  58.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  31.8 
 
 
2040 aa  57.8  0.0000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  32.88 
 
 
2011 aa  57.4  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3256  outer membrane adhesin like proteiin  35.83 
 
 
1268 aa  57.4  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3933  PKD domain containing protein  30.51 
 
 
1502 aa  57.4  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.114839  normal  0.527223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3952  hypothetical protein  34.11 
 
 
3191 aa  57  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627694  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5274  outer membrane adhesin like protein  32.48 
 
 
2377 aa  56.6  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.941453  normal  0.210055 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  34.72 
 
 
2084 aa  56.2  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1890  integrin, beta chain-like  28.44 
 
 
663 aa  55.5  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  32.76 
 
 
2067 aa  55.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  34.06 
 
 
2056 aa  53.9  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  32.67 
 
 
2047 aa  53.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3869  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.53 
 
 
3816 aa  53.1  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  33.8 
 
 
2051 aa  52.8  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2362  putative outer membrane adhesin like proteiin  33.17 
 
 
994 aa  53.1  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.112717  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6214  hypothetical protein  43.52 
 
 
1752 aa  52.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0213789 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  31.02 
 
 
2807 aa  52  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  32.43 
 
 
2522 aa  51.6  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1294  polyhydroxyalkanoate synthesis repressor PhaR  27.72 
 
 
8321 aa  50.1  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.359322 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0223  fibronectin, type III  30.43 
 
 
1911 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1063  hypothetical protein  30.89 
 
 
800 aa  50.8  0.0001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.417069  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0783  outer membrane adhesin like proteiin  43.01 
 
 
4748 aa  50.1  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  31.88 
 
 
3089 aa  50.1  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  31.58 
 
 
2476 aa  50.1  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1291  outer membrane adhesin like proteiin  28.04 
 
 
2555 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.983971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  34.16 
 
 
5769 aa  48.5  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0577  outer membrane adhesin like proteiin  32.51 
 
 
2074 aa  47.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.144033 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2359  putative outer membrane adhesin like proteiin  34.69 
 
 
761 aa  47  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.658251  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  29.73 
 
 
3544 aa  47.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2716  hypothetical protein  33.62 
 
 
516 aa  46.6  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2653  hypothetical protein  27.67 
 
 
676 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.135557  normal  0.0988839 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5368  outer membrane adhesin like protein  33.48 
 
 
3927 aa  46.2  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3885  RTX cytolytic toxin protein A  40.95 
 
 
1394 aa  45.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0563  type 1 secretion C-terminal target domain protein  30 
 
 
1706 aa  45.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3594  outer membrane adhesin like proteiin  28.89 
 
 
1215 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  33.01 
 
 
3471 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0560  putative outer membrane adhesin like protein  35 
 
 
1215 aa  44.3  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2796  fibronectin type III domain-containing protein  33.1 
 
 
2153 aa  44.3  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3393  putative outer membrane adhesin like protein  35 
 
 
1215 aa  43.9  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0139307 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003404  putative RTX toxin  26.57 
 
 
4848 aa  43.9  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1048  hypothetical protein  33.98 
 
 
1126 aa  43.9  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00227105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>