146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1543 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  100 
 
 		 782 aa  1573    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  37.68 
 
 		 1628 aa  176  9.999999999999999e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  36.44 
 
 		 795 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0642  Fibronectin type III domain protein  36.71 
 
 		 692 aa  154  8.999999999999999e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.022056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2022  fibronectin, type III domain-containing protein  36.53 
 
 		 683 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00638663  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  47.39 
 
 		 1199 aa  139  3.0000000000000003e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2185  fibronectin, type III  46.42 
 
 		 656 aa  130  1.0000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0292079  hitchhiker  0.000132126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  31.67 
 
 		 1462 aa  124  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  29.33 
 
 		 9585 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  40.21 
 
 		 3027 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04160  beta-1,3-glucanase  42.39 
 
 		 1067 aa  108  3e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  26.62 
 
 		 1172 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  32.7 
 
 		 1363 aa  99.4  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  28.37 
 
 		 741 aa  97.8  6e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.22 
 
 		 6885 aa  95.9  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  29.84 
 
 		 480 aa  95.5  4e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  32.32 
 
 		 1363 aa  92  4e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  30.8 
 
 		 1380 aa  90.5  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6593  fibronectin type III domain-containing protein  31.18 
 
 		 428 aa  88.6  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  29.89 
 
 		 649 aa  88.2  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  26.68 
 
 		 2068 aa  87.4  9e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4289  glycoside hydrolase family 5  32.93 
 
 		 717 aa  87.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.162807  normal  0.0359435 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0648  Fibronectin type III domain protein  33.44 
 
 		 1795 aa  86.3  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.034686  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  38.42 
 
 		 3802 aa  85.1  0.000000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  23.56 
 
 		 444 aa  84.3  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  37.38 
 
 		 1695 aa  84.3  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  28.86 
 
 		 2286 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  27.1 
 
 		 1401 aa  82.8  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  25.83 
 
 		 779 aa  83.2  0.00000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  35.71 
 
 		 918 aa  82  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  36.61 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  44.68 
 
 		 834 aa  80.9  0.00000000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  28.38 
 
 		 3507 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1919  Chitinase-like protein  38.89 
 
 		 680 aa  80.1  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2193  carbohydrate-binding family 6 protein  41.61 
 
 		 948 aa  79.7  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.43679  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  32.09 
 
 		 5743 aa  79.7  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0896  Fibronectin type III domain protein  30 
 
 		 804 aa  78.2  0.0000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  38.58 
 
 		 1160 aa  77.8  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0704  Fibronectin type III domain protein  44.44 
 
 		 718 aa  77.8  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1730  cysteine-rich repeat protein  29.95 
 
 		 780 aa  77  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.120175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  51.11 
 
 		 739 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  25.8 
 
 		 404 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  28.83 
 
 		 1973 aa  76.3  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1632  Fibronectin type III domain protein  33.6 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  52.27 
 
 		 757 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  34.41 
 
 		 1065 aa  75.9  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  25.87 
 
 		 1042 aa  75.1  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5269  Fibronectin type III domain protein  29.59 
 
 		 1633 aa  75.1  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.803528  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0017  fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 207 aa  75.1  0.000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.857049  normal  0.0757173 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  24.54 
 
 		 410 aa  73.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  24.54 
 
 		 410 aa  72.4  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  26.79 
 
 		 404 aa  72.8  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  27.63 
 
 		 3333 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05360  fibronectin type 3 domain-containing protein  26.94 
 
 		 1880 aa  72  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  52.81 
 
 		 1847 aa  72  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5990  Carbohydrate-binding CenC domain protein  38.51 
 
 		 648 aa  71.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.793128  normal  0.422272 
 
 
-
 
NC_003296  RS01652  putative transmembrane protein  50.59 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.993678  normal  0.0258768 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04370  hypothetical protein  30.91 
 
 		 445 aa  70.5  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  42.86 
 
 		 1753 aa  69.7  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  46.67 
 
 		 739 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  25.94 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.17 
 
 		 903 aa  68.6  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  25.7 
 
 		 4433 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4777  glycoside hydrolase family 18 protein  25.89 
 
 		 803 aa  66.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.202282  normal  0.127676 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  43.14 
 
 		 1401 aa  66.6  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  25.07 
 
 		 680 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3272  alpha amylase catalytic region  29.22 
 
 		 1643 aa  66.6  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1747  hypothetical protein  36.43 
 
 		 1139 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000564232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  32 
 
 		 1247 aa  65.1  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  27.23 
 
 		 995 aa  64.3  0.000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  28 
 
 		 1735 aa  64.3  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  41.49 
 
 		 1307 aa  63.9  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  33.46 
 
 		 1248 aa  63.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 459 aa  63.5  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  24 
 
 		 409 aa  63.9  0.00000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  29.38 
 
 		 841 aa  63.5  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4173  Fibronectin type III domain protein  26.14 
 
 		 1142 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0773  Fibronectin type III domain protein  26.18 
 
 		 554 aa  61.2  0.00000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.310071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  25.27 
 
 		 394 aa  60.1  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  30.12 
 
 		 744 aa  57.4  0.0000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0381  Fibronectin type III domain protein  31.28 
 
 		 277 aa  57.4  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  33.86 
 
 		 409 aa  56.2  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1552  fibronectin type III domain-containing protein  24.24 
 
 		 1131 aa  56.2  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0138471  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04176  exoglucanase A  44.44 
 
 		 548 aa  56.6  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  39.81 
 
 		 918 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3604  glycoside hydrolase family 48  31.46 
 
 		 973 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1051  endoglucanase-related protein  39.19 
 
 		 1295 aa  55.8  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.222685 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  34.75 
 
 		 869 aa  55.1  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2773  fibronectin, type III  40.74 
 
 		 1115 aa  54.7  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2946  hypothetical protein  35.14 
 
 		 733 aa  54.7  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.0000000153655  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0363  Fibronectin type III domain protein  47.37 
 
 		 278 aa  54.7  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00588673 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  42.7 
 
 		 1242 aa  53.5  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1793  fibronectin type III domain-containing protein  39.62 
 
 		 224 aa  53.9  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  28.27 
 
 		 771 aa  52.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  29.71 
 
 		 836 aa  52.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  26.25 
 
 		 2170 aa  53.1  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  26.3 
 
 		 2039 aa  53.1  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  24.51 
 
 		 690 aa  52  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  31.18 
 
 		 1230 aa  51.2  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2065  Poly(3-hydroxybutyrate) depolymerase  28.39 
 
 		 506 aa  51.2  0.00007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.140778  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>