50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0610 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 404 aa  825    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  57.18 
 
 		 410 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  55.91 
 
 		 410 aa  477  1e-133  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0446  fibronectin type III domain-containing protein  55.42 
 
 		 409 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1219  fibronectin type III domain-containing protein  43.83 
 
 		 388 aa  328  7e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  42.35 
 
 		 394 aa  296  3e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  38.9 
 
 		 404 aa  272  6e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0784  fibronectin, type III  36.65 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0508  diaminopimelate decarboxylase dap decarboxylase  47.25 
 
 		 181 aa  186  7e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  29.17 
 
 		 741 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.69 
 
 		 6885 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009673  Bcer98_4034  fibronectin type III domain-containing protein  26.62 
 
 		 454 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  22.34 
 
 		 1462 aa  60.5  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  22.56 
 
 		 680 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7155  Glucodextranase N  24.77 
 
 		 1160 aa  58.2  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0849564  normal  0.457795 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  26.09 
 
 		 771 aa  55.5  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  25.14 
 
 		 455 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  26.03 
 
 		 1735 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  25.14 
 
 		 455 aa  53.1  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  24.45 
 
 		 1042 aa  53.1  0.000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 1230 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  25.37 
 
 		 455 aa  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  23.51 
 
 		 795 aa  51.6  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  26.74 
 
 		 455 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2155  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  25.6 
 
 		 649 aa  50.8  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000475992  n/a   
 
 
-
 
NC_011654  BCAH187_D0017  fibronectin type III domain protein  24.68 
 
 		 481 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  20.51 
 
 		 1973 aa  50.8  0.00004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  26.89 
 
 		 1695 aa  50.4  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  24.59 
 
 		 455 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  26.53 
 
 		 458 aa  49.3  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  25.81 
 
 		 455 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  27.17 
 
 		 2068 aa  48.5  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  23.5 
 
 		 455 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  24.04 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  23.5 
 
 		 455 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  23.21 
 
 		 459 aa  47.4  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  24.93 
 
 		 690 aa  46.6  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  24.04 
 
 		 455 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2328  fibronectin, type III domain-containing protein  31.08 
 
 		 675 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000140812  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0276  chitin-binding protein  25.64 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.281673  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  24.59 
 
 		 1380 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0036  chitin-binding domain protein  25.13 
 
 		 456 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0067572  normal  0.0435633 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1100  FG-GAP repeat protein  27.96 
 
 		 1065 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  23.06 
 
 		 779 aa  43.5  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  30.39 
 
 		 3027 aa  43.9  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  21.39 
 
 		 3507 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  21.18 
 
 		 480 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  28.4 
 
 		 3802 aa  42.7  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  25.47 
 
 		 9585 aa  42.7  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2278  alpha amylase catalytic region  27.54 
 
 		 1307 aa  42.7  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.792883  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>