37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2773 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 690 aa  1430    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3451  hypothetical protein  23.58 
 
 		 687 aa  163  1e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00623821 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  28.52 
 
 		 1462 aa  84  0.000000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  24.77 
 
 		 1042 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  25.44 
 
 		 480 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  24.05 
 
 		 741 aa  60.5  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  27.74 
 
 		 6885 aa  59.3  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2604  chitin binding protein  25.31 
 
 		 455 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.314994  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2793  chitin binding protein  25.31 
 
 		 455 aa  55.5  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  29.21 
 
 		 3802 aa  53.9  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4881  glycoside hydrolase family 6  30.53 
 
 		 743 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2666  glycosy hydrolase family protein  36.36 
 
 		 970 aa  52.4  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  22.81 
 
 		 680 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2803  putative chitinase  24.43 
 
 		 455 aa  52  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2487  putative chitinase  25.16 
 
 		 455 aa  52  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.676693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2598  chitin-binding domain-containing protein  24.76 
 
 		 455 aa  52  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0071458  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2212  chitin-binding domain-containing protein  27.34 
 
 		 459 aa  51.2  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000239148  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2824  chitin binding protein, putative  25.39 
 
 		 455 aa  50.4  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00573769  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2346  chitin-binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.179071  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1295  fibronectin type III domain-containing protein  23.53 
 
 		 410 aa  48.9  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2523  chitin-binding protein  25.08 
 
 		 455 aa  48.9  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4335  alpha amylase catalytic region  27.73 
 
 		 1753 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.167512  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2800  putative chitinase  25.62 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000304413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2845  putative chitinase  24.69 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00670529  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2556  chitin-binding protein  25.62 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.840991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0640  Fibronectin type III domain protein  22.87 
 
 		 404 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0068  fibronectin, type III domain-containing protein  25.73 
 
 		 1695 aa  48.1  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  21.96 
 
 		 1973 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  20.16 
 
 		 394 aa  47  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1415  fibronectin type III domain-containing protein  23.27 
 
 		 410 aa  46.6  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4515  APHP domain-containing protein  50 
 
 		 5743 aa  46.6  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  24.93 
 
 		 404 aa  46.6  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  24.02 
 
 		 1199 aa  45.4  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  27.32 
 
 		 2170 aa  45.1  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  21.39 
 
 		 3507 aa  45.1  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  22.29 
 
 		 9585 aa  45.1  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  26.43 
 
 		 1363 aa  44.7  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>