More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2454 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  100 
 
 		 1042 aa  2121    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  30.69 
 
 		 779 aa  292  2e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  32.71 
 
 		 480 aa  180  1e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  42.39 
 
 		 6885 aa  142  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  39.69 
 
 		 547 aa  138  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  28.15 
 
 		 2068 aa  138  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  41.27 
 
 		 631 aa  137  9e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  32.96 
 
 		 3507 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  33.7 
 
 		 729 aa  131  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  25.83 
 
 		 1973 aa  129  4.0000000000000003e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.61 
 
 		 1016 aa  127  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  39.66 
 
 		 1174 aa  127  1e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  38.55 
 
 		 2286 aa  120  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  31.71 
 
 		 3320 aa  120  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  35.68 
 
 		 1495 aa  116  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  35.36 
 
 		 2375 aa  112  5e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  36.41 
 
 		 609 aa  111  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  36.59 
 
 		 527 aa  111  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  37.1 
 
 		 1847 aa  110  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  36.22 
 
 		 1226 aa  109  3e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  34.59 
 
 		 1321 aa  107  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  31.65 
 
 		 506 aa  106  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  36.02 
 
 		 1013 aa  105  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  32.2 
 
 		 756 aa  106  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  36.9 
 
 		 935 aa  106  3e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  35.71 
 
 		 1009 aa  105  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  35.88 
 
 		 1194 aa  104  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  36.99 
 
 		 2207 aa  104  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  35.68 
 
 		 548 aa  103  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  33.72 
 
 		 758 aa  103  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  35.11 
 
 		 932 aa  102  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  33.7 
 
 		 1457 aa  101  9e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.72 
 
 		 2073 aa  100  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  27.55 
 
 		 4433 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  34.5 
 
 		 518 aa  99.4  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.26 
 
 		 1661 aa  98.6  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  37.22 
 
 		 625 aa  98.6  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  31.89 
 
 		 926 aa  98.2  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  32.4 
 
 		 1421 aa  97.1  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  33.33 
 
 		 524 aa  95.5  5e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  25.63 
 
 		 2286 aa  95.1  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1839  S-layer domain protein  35.12 
 
 		 575 aa  94.7  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  36.67 
 
 		 554 aa  94.7  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1043  hypothetical protein  31.89 
 
 		 754 aa  94.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3210  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.41 
 
 		 533 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5468  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.41 
 
 		 533 aa  93.6  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000294756  normal  0.0109567 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  31.44 
 
 		 920 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  28.12 
 
 		 506 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  34.3 
 
 		 820 aa  93.6  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0777  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.11 
 
 		 567 aa  92.8  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.173449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  36.2 
 
 		 457 aa  92.4  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  31.52 
 
 		 1821 aa  92  5e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  30.43 
 
 		 573 aa  92  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.41 
 
 		 1029 aa  91.3  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.63 
 
 		 567 aa  91.3  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000032251 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  32.62 
 
 		 1168 aa  90.5  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  36.31 
 
 		 733 aa  90.5  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0925  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.06 
 
 		 572 aa  89.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.702364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  32.16 
 
 		 526 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  26.65 
 
 		 9585 aa  89.4  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  30.43 
 
 		 1260 aa  89.4  3e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.56 
 
 		 1054 aa  89.4  4e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3111  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.64 
 
 		 539 aa  88.6  5e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000635651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  35.03 
 
 		 594 aa  88.6  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  24.52 
 
 		 1462 aa  88.2  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.3 
 
 		 995 aa  88.2  7e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  30.05 
 
 		 1729 aa  88.2  8e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  37.5 
 
 		 1710 aa  87.8  9e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  27.4 
 
 		 1363 aa  87.8  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  34.41 
 
 		 223 aa  87.8  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  32.95 
 
 		 669 aa  87.4  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  33.33 
 
 		 930 aa  87  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.4 
 
 		 1363 aa  85.9  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  30.89 
 
 		 880 aa  85.9  0.000000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  50.62 
 
 		 340 aa  85.5  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  32.61 
 
 		 414 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  34.41 
 
 		 558 aa  85.5  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  33.15 
 
 		 693 aa  85.1  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  33.14 
 
 		 531 aa  85.1  0.000000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  34.81 
 
 		 546 aa  84  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase and S-layer protein fusion  31.49 
 
 		 599 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  26.17 
 
 		 717 aa  83.2  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1979  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.49 
 
 		 599 aa  83.6  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  27.05 
 
 		 1380 aa  83.6  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  32.79 
 
 		 413 aa  82.8  0.00000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  37.33 
 
 		 1113 aa  82.8  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2877  S-layer-like domain-containing protein  31.12 
 
 		 585 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2329  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.32 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  30.26 
 
 		 674 aa  82  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  32.43 
 
 		 542 aa  82  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  31.75 
 
 		 413 aa  81.6  0.00000000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  33.52 
 
 		 548 aa  81.6  0.00000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  34.25 
 
 		 552 aa  81.6  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  33.71 
 
 		 876 aa  81.3  0.00000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3463  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.4 
 
 		 575 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.219832  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32.35 
 
 		 618 aa  80.9  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3737  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.4 
 
 		 575 aa  80.9  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  32.45 
 
 		 540 aa  80.1  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  36.84 
 
 		 670 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  31.18 
 
 		 431 aa  79.7  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>