More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0317 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  100 
 
 		 820 aa  1648    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  44.85 
 
 		 1194 aa  228  3e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  40.16 
 
 		 548 aa  220  1e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  41.28 
 
 		 457 aa  205  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  57.06 
 
 		 625 aa  199  2.0000000000000003e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  51.93 
 
 		 758 aa  196  1e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1963  hypothetical protein  51.67 
 
 		 518 aa  195  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  52.05 
 
 		 526 aa  194  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  34.69 
 
 		 685 aa  171  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  29.76 
 
 		 693 aa  161  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  29.79 
 
 		 573 aa  147  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1798  hypothetical protein  43.71 
 
 		 218 aa  147  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.351482  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  32.89 
 
 		 932 aa  145  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2145  hypothetical protein  40 
 
 		 629 aa  145  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0965405 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.32 
 
 		 1029 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1961  Ig domain protein group 2 domain protein  37.62 
 
 		 1821 aa  134  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0983337  normal  0.347349 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1982  S-layer domain protein  37.38 
 
 		 506 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.192953  normal  0.0752938 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2680  S-layer domain-containing protein  32.33 
 
 		 1174 aa  132  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  31.33 
 
 		 1168 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  35.24 
 
 		 935 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  39.01 
 
 		 1009 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  34.95 
 
 		 710 aa  126  1e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  34.34 
 
 		 1208 aa  125  3e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  38.15 
 
 		 1013 aa  125  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0056  Ig-like, group 2  34.74 
 
 		 4630 aa  124  7e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2783  S-layer domain protein  37.08 
 
 		 1154 aa  124  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.364691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  39.77 
 
 		 542 aa  122  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0120  S-layer domain protein  40.11 
 
 		 767 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  35.02 
 
 		 1847 aa  121  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  31.76 
 
 		 618 aa  120  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  29.86 
 
 		 921 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2998  S-layer domain-containing protein  34.86 
 
 		 926 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3986  S-layer domain protein  35.09 
 
 		 920 aa  117  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00445864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  34.22 
 
 		 1226 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.59 
 
 		 1016 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  35 
 
 		 506 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  30.99 
 
 		 756 aa  115  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2129  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.91 
 
 		 1328 aa  114  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1505  S-layer-like domain-containing protein  37.93 
 
 		 223 aa  114  6e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  32.37 
 
 		 524 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2015  S-layer domain protein  33.14 
 
 		 288 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.859332  normal  0.142835 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.99 
 
 		 631 aa  113  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  36.46 
 
 		 548 aa  110  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1699  protein of unknown function DUF1533  29.41 
 
 		 1916 aa  109  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0673  S-layer domain protein  32.57 
 
 		 431 aa  108  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  31.55 
 
 		 1260 aa  108  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  32.14 
 
 		 1321 aa  107  8e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0656  hypothetical protein  34.66 
 
 		 660 aa  107  9e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000140636  hitchhiker  0.000000360107 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1924  hypothetical protein  35.63 
 
 		 657 aa  106  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.398091  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3985  S-layer domain protein  34.5 
 
 		 531 aa  107  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.664034  hitchhiker  0.000502969 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  31.4 
 
 		 554 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3178  hypothetical protein  34.57 
 
 		 552 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.925927  normal  0.121635 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4228  hypothetical protein  31.03 
 
 		 693 aa  106  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0443  hypothetical protein  34.22 
 
 		 413 aa  106  2e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  35.19 
 
 		 1081 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2108  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.8 
 
 		 995 aa  105  4e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.557195  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  33.52 
 
 		 414 aa  105  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3135  hypothetical protein  33.89 
 
 		 624 aa  105  5e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2155  S-layer-like domain-containing protein  36.36 
 
 		 631 aa  103  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  33.52 
 
 		 669 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3122  S-layer-like domain-containing protein  32.8 
 
 		 692 aa  103  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  33.33 
 
 		 733 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0012  YD repeat protein  31.35 
 
 		 3027 aa  100  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0087  S-layer domain protein  33.53 
 
 		 1223 aa  100  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3446  S-layer domain-containing protein  35.11 
 
 		 876 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0601  hypothetical protein  33.93 
 
 		 546 aa  100  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2734  S-layer domain-containing protein  31.82 
 
 		 413 aa  99.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.115763  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  28.83 
 
 		 914 aa  99.4  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0788  S-layer protein, peptidoglycan endo-beta-N-acetylglucosaminidase and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion  34.34 
 
 		 615 aa  99.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  0.00000000000000356588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  33.53 
 
 		 939 aa  98.2  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  31.67 
 
 		 547 aa  97.4  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  39.05 
 
 		 729 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3449  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.66 
 
 		 843 aa  96.3  2e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3078  cellulosome anchoring protein, cohesin region  34.57 
 
 		 2313 aa  96.7  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  34.3 
 
 		 1042 aa  96.3  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4824  Beta-Ig-H3/fasciclin  31.25 
 
 		 558 aa  95.9  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.597464  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.14 
 
 		 1054 aa  95.9  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2613  S-layer-like domain-containing protein  27.06 
 
 		 286 aa  95.1  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1010  NEAr transporter  38.64 
 
 		 343 aa  94.7  6e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.851709  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1093  S-layer protein  33.62 
 
 		 344 aa  94.4  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1021  S-layer protein  33.62 
 
 		 346 aa  94.4  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.347514  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  33.5 
 
 		 594 aa  94  9e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1195  S-layer protein, putative  38.64 
 
 		 345 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  30 
 
 		 2207 aa  93.6  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0933  S-layer protein  30.41 
 
 		 620 aa  93.6  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000133918  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4160  S-layer domain protein  29.94 
 
 		 834 aa  93.2  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000123931  normal  0.0864092 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  30.6 
 
 		 1661 aa  92.8  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0077  S-layer domain protein  31.36 
 
 		 1710 aa  93.2  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1177  putative S-layer protein  38.07 
 
 		 344 aa  93.2  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  29.49 
 
 		 2073 aa  92.8  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  32.94 
 
 		 822 aa  92.4  3e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1008  cell-wall amidase, pXO2-42-like protein  38.07 
 
 		 342 aa  92  3e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.8241  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  28.62 
 
 		 6885 aa  92.4  3e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0784  S-layer domain-containing protein  30.46 
 
 		 620 aa  92  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000163217  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2364  S-layer domain protein  34.13 
 
 		 1421 aa  91.7  5e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00153299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  28.12 
 
 		 376 aa  91.7  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  33.33 
 
 		 410 aa  91.3  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  53.41 
 
 		 848 aa  90.9  8e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4398  S-layer protein  29.24 
 
 		 620 aa  90.9  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000740229  hitchhiker  0.00000000000010382 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3080  cellulosome anchoring protein, cohesin region  35.98 
 
 		 447 aa  90.5  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>