More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0054 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  100 
 
 		 729 aa  1501    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  37.33 
 
 		 717 aa  451  1e-125  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  43.84 
 
 		 534 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  40.59 
 
 		 519 aa  398  1e-109  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  52.08 
 
 		 393 aa  398  1e-109  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  49.74 
 
 		 447 aa  395  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  39.71 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  40.15 
 
 		 519 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  43.57 
 
 		 521 aa  393  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  40.41 
 
 		 519 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  50.53 
 
 		 442 aa  395  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  43.37 
 
 		 521 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  40.22 
 
 		 519 aa  392  1e-107  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  40.22 
 
 		 519 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  43.17 
 
 		 554 aa  389  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  43.34 
 
 		 494 aa  392  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  40.56 
 
 		 519 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  43.17 
 
 		 521 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  39.85 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  40.04 
 
 		 519 aa  388  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  50.78 
 
 		 393 aa  386  1e-106  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  42.15 
 
 		 551 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  43.17 
 
 		 521 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  40.04 
 
 		 517 aa  385  1e-105  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  45.67 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  45.67 
 
 		 427 aa  382  1e-105  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  49.48 
 
 		 393 aa  379  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  48.93 
 
 		 451 aa  377  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  46.08 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  46.33 
 
 		 439 aa  372  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  46.33 
 
 		 439 aa  372  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  47.01 
 
 		 384 aa  369  1e-101  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  46.33 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  46.33 
 
 		 439 aa  372  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  46.08 
 
 		 439 aa  370  1e-101  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  46.33 
 
 		 439 aa  372  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  46.08 
 
 		 404 aa  369  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  48.17 
 
 		 435 aa  366  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  48.77 
 
 		 431 aa  365  1e-99  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  48.49 
 
 		 409 aa  363  4e-99  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  43.79 
 
 		 431 aa  362  1e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  42.42 
 
 		 431 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  45.26 
 
 		 378 aa  354  2.9999999999999997e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  40.08 
 
 		 547 aa  343  9e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  38.33 
 
 		 538 aa  342  1e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  40.12 
 
 		 519 aa  338  2.9999999999999997e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  36.46 
 
 		 532 aa  334  4e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  39.07 
 
 		 528 aa  332  2e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  39.51 
 
 		 533 aa  330  5.0000000000000004e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  40.2 
 
 		 540 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  39.23 
 
 		 520 aa  326  9e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  37.7 
 
 		 508 aa  320  7e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  38.68 
 
 		 676 aa  319  1e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  35.45 
 
 		 551 aa  319  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  36.83 
 
 		 550 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  38.16 
 
 		 538 aa  311  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  35.5 
 
 		 540 aa  310  8e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  35.14 
 
 		 509 aa  306  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  37.62 
 
 		 570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  40.53 
 
 		 997 aa  301  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  39.9 
 
 		 406 aa  300  6e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  34.38 
 
 		 669 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  37.63 
 
 		 437 aa  267  4e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  40.55 
 
 		 523 aa  260  6e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4809  hypothetical protein  33.93 
 
 		 493 aa  255  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  33.83 
 
 		 521 aa  253  9.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  32.24 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2775  protein of unknown function DUF187  32.69 
 
 		 605 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000508646  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  29.87 
 
 		 508 aa  227  6e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  34.26 
 
 		 481 aa  223  9.999999999999999e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  30.29 
 
 		 486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  32.26 
 
 		 490 aa  202  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  29.21 
 
 		 515 aa  171  4e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  49.72 
 
 		 6885 aa  163  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  44.32 
 
 		 631 aa  146  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  33.7 
 
 		 1042 aa  131  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  30.22 
 
 		 547 aa  120  7e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  33.53 
 
 		 2286 aa  118  3.9999999999999997e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  39.33 
 
 		 3320 aa  117  6.9999999999999995e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  34.07 
 
 		 1661 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  39.23 
 
 		 1009 aa  107  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  35.75 
 
 		 609 aa  106  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.08 
 
 		 1016 aa  106  1e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  34.91 
 
 		 930 aa  105  4e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  38.12 
 
 		 932 aa  104  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  36.63 
 
 		 2375 aa  101  6e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  35 
 
 		 1847 aa  100  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  31.36 
 
 		 1260 aa  100  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  35.96 
 
 		 1013 aa  97.4  8e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  35.96 
 
 		 506 aa  97.4  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  33.5 
 
 		 935 aa  97.1  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  31.22 
 
 		 1495 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  38.51 
 
 		 1050 aa  95.1  4e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  31.67 
 
 		 1457 aa  92  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.8 
 
 		 1029 aa  91.3  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  31.67 
 
 		 2073 aa  90.5  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  36.69 
 
 		 526 aa  89.4  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0141  hypothetical protein  39.05 
 
 		 758 aa  89.7  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  29.63 
 
 		 1321 aa  88.2  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>