102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS01950 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  100 
 
 		 447 aa  910    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  74.54 
 
 		 378 aa  580  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  64.52 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  64.95 
 
 		 393 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  64.52 
 
 		 393 aa  544  1e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  58.33 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  58.58 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  58.33 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  62.76 
 
 		 451 aa  508  1e-143  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  58.81 
 
 		 442 aa  495  1e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  58.49 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  57.57 
 
 		 431 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  58.49 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  58.49 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  56.33 
 
 		 439 aa  489  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  58.49 
 
 		 404 aa  488  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.50348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  58.22 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  58.51 
 
 		 409 aa  488  1e-136  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  58.49 
 
 		 384 aa  487  1e-136  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  58.22 
 
 		 404 aa  486  1e-136  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  58.22 
 
 		 439 aa  487  1e-136  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  58.49 
 
 		 435 aa  479  1e-134  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  55.96 
 
 		 431 aa  458  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  56.48 
 
 		 431 aa  455  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  49.74 
 
 		 729 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  44.77 
 
 		 519 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  45.48 
 
 		 519 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  44.77 
 
 		 519 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  44.77 
 
 		 519 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  44.77 
 
 		 519 aa  326  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  45.48 
 
 		 534 aa  325  9e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  43.04 
 
 		 550 aa  323  4e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  45.48 
 
 		 519 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  44.93 
 
 		 519 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  44.66 
 
 		 519 aa  320  3e-86  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  42.72 
 
 		 538 aa  320  3.9999999999999996e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  44.47 
 
 		 528 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  42.28 
 
 		 406 aa  317  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  46.43 
 
 		 521 aa  317  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  46.43 
 
 		 554 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  46.43 
 
 		 494 aa  316  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  46.43 
 
 		 521 aa  317  4e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  46.43 
 
 		 521 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  46.43 
 
 		 521 aa  316  5e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  41.25 
 
 		 517 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  44.38 
 
 		 519 aa  315  9.999999999999999e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  45.33 
 
 		 551 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  42.55 
 
 		 717 aa  310  2e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  40.62 
 
 		 997 aa  303  5.000000000000001e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  38.85 
 
 		 551 aa  302  9e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  45.28 
 
 		 540 aa  301  2e-80  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  42.32 
 
 		 547 aa  298  1e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  43.41 
 
 		 533 aa  296  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  38.87 
 
 		 437 aa  294  3e-78  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  42.32 
 
 		 676 aa  292  8e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  38.86 
 
 		 520 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  41.24 
 
 		 538 aa  285  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  40 
 
 		 540 aa  274  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  39.51 
 
 		 523 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4809  hypothetical protein  38.92 
 
 		 493 aa  270  2.9999999999999997e-71  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  37.59 
 
 		 532 aa  269  7e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  39.62 
 
 		 570 aa  267  2.9999999999999995e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  39.49 
 
 		 519 aa  263  4e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  37.43 
 
 		 509 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  37.9 
 
 		 508 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  38.91 
 
 		 512 aa  227  3e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  37.35 
 
 		 669 aa  211  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  34.05 
 
 		 481 aa  210  5e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  34.08 
 
 		 490 aa  203  6e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  36.5 
 
 		 508 aa  202  9.999999999999999e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2775  protein of unknown function DUF187  31.59 
 
 		 605 aa  200  3.9999999999999996e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000508646  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  34.24 
 
 		 521 aa  197  3e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  32.44 
 
 		 486 aa  190  2.9999999999999997e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  35.52 
 
 		 515 aa  171  2e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  23.25 
 
 		 906 aa  78.2  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  32.6 
 
 		 536 aa  77  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1609  hypothetical protein  26.62 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0289476 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  25.68 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  24.54 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  25.68 
 
 		 535 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  28.66 
 
 		 911 aa  65.1  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  25 
 
 		 437 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  27.96 
 
 		 906 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  27.57 
 
 		 906 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  24.72 
 
 		 416 aa  62.4  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  26.1 
 
 		 380 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  25.61 
 
 		 430 aa  56.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  24.22 
 
 		 395 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  22.06 
 
 		 1099 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  27.74 
 
 		 420 aa  54.7  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1370  hypothetical protein  24.58 
 
 		 384 aa  54.7  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  25.51 
 
 		 406 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  27.71 
 
 		 383 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  23.62 
 
 		 427 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  23.8 
 
 		 427 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  25.84 
 
 		 410 aa  51.2  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  23.4 
 
 		 430 aa  50.4  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  25.14 
 
 		 760 aa  49.3  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  26.49 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  23.16 
 
 		 345 aa  47.4  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>