More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2221 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  100 
 
 
997 aa  2036    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  45.39 
 
 
519 aa  380  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  45.8 
 
 
519 aa  379  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  45.74 
 
 
519 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  45.74 
 
 
519 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  45.56 
 
 
519 aa  375  1e-102  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  44.6 
 
 
519 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  44.71 
 
 
519 aa  373  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  41.61 
 
 
534 aa  372  1e-101  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  44.36 
 
 
519 aa  370  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  47.26 
 
 
517 aa  367  1e-100  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  44.12 
 
 
519 aa  370  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  45.04 
 
 
717 aa  362  3e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  45.92 
 
 
550 aa  355  2e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  41.93 
 
 
551 aa  349  1e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  41.67 
 
 
554 aa  346  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  41.67 
 
 
521 aa  346  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  41.67 
 
 
494 aa  345  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  45.77 
 
 
406 aa  345  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  41.67 
 
 
521 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  41.67 
 
 
521 aa  345  2e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  42.22 
 
 
547 aa  343  5.999999999999999e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  40.95 
 
 
551 aa  342  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  41.15 
 
 
521 aa  342  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  44.24 
 
 
437 aa  337  5.999999999999999e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  41.44 
 
 
538 aa  335  2e-90  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  44.57 
 
 
533 aa  334  6e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  43.67 
 
 
520 aa  332  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  43.17 
 
 
528 aa  327  6e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  42.34 
 
 
540 aa  324  5e-87  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  40.62 
 
 
508 aa  322  1.9999999999999998e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  43.51 
 
 
540 aa  319  2e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  41.4 
 
 
676 aa  317  9.999999999999999e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  41.56 
 
 
509 aa  314  5.999999999999999e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  43.13 
 
 
519 aa  311  4e-83  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  42.47 
 
 
538 aa  308  2.0000000000000002e-82  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  39.89 
 
 
532 aa  304  6.000000000000001e-81  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  40.62 
 
 
447 aa  303  1e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4809  hypothetical protein  42.66 
 
 
493 aa  303  1e-80  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2268  cell wall hydrolase/autolysin  32.46 
 
 
585 aa  301  3e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  40.53 
 
 
729 aa  301  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  40.26 
 
 
427 aa  299  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  40 
 
 
427 aa  298  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  40 
 
 
427 aa  298  5e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  39.84 
 
 
570 aa  295  4e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  38.32 
 
 
439 aa  292  2e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  38.32 
 
 
439 aa  293  2e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  38.32 
 
 
439 aa  292  2e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  38.32 
 
 
439 aa  293  2e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  40.05 
 
 
442 aa  292  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  38.32 
 
 
439 aa  292  3e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  38.32 
 
 
439 aa  292  3e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  38.32 
 
 
404 aa  292  3e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  38.44 
 
 
431 aa  291  5.0000000000000004e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  39.51 
 
 
435 aa  291  5.0000000000000004e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  38.06 
 
 
404 aa  290  7e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  38.96 
 
 
384 aa  289  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  39.63 
 
 
409 aa  288  4e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  39.13 
 
 
393 aa  287  5e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  39.69 
 
 
393 aa  287  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  39.18 
 
 
393 aa  283  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  40.82 
 
 
523 aa  280  9e-74  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1825  cell wall hydrolase/autolysin  29.82 
 
 
590 aa  279  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0714  cell wall hydrolase/autolysin  29.34 
 
 
568 aa  276  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000891382  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  38.08 
 
 
378 aa  276  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4053  cell wall hydrolase/autolysin  30.65 
 
 
585 aa  273  2e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  36.04 
 
 
431 aa  272  2e-71  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  36.86 
 
 
431 aa  271  2.9999999999999997e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3067  cell wall hydrolase/autolysin  29.86 
 
 
591 aa  267  8e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3053  cell wall hydrolase/autolysin  29.86 
 
 
591 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0425538  normal  0.806567 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4034  cell wall hydrolase/autolysin  29.13 
 
 
636 aa  265  4e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  34.64 
 
 
451 aa  264  6.999999999999999e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  34.8 
 
 
521 aa  254  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  36.03 
 
 
512 aa  253  2e-65  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3265  cell wall hydrolase/autolysin  28.37 
 
 
556 aa  250  8e-65  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  39.67 
 
 
508 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  36.58 
 
 
669 aa  242  2.9999999999999997e-62  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  35.84 
 
 
490 aa  236  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  31.78 
 
 
486 aa  219  2.9999999999999998e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  34.46 
 
 
481 aa  218  4e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2775  protein of unknown function DUF187  33.25 
 
 
605 aa  206  2e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000508646  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0068  cell wall hydrolase/autolysin  35.48 
 
 
560 aa  198  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  28.16 
 
 
515 aa  153  2e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1272  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.75 
 
 
242 aa  102  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000305091 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1509  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  36.99 
 
 
751 aa  102  5e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0136849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.32 
 
 
746 aa  99.8  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1077  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.95 
 
 
657 aa  98.6  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0200962 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0232  cell wall hydrolase/autolysin  28.74 
 
 
641 aa  98.6  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.416726  normal  0.560186 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0517  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.2 
 
 
657 aa  97.8  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000337238  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1016  cell wall hydrolase/autolysin  32.52 
 
 
352 aa  95.5  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000634005  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0618  cell wall hydrolase/autolysin  34.27 
 
 
451 aa  95.5  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000253724  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0859  cell wall hydrolase/autolysin  33.16 
 
 
231 aa  94.7  8e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.751216 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1034  cell wall hydrolase/autolysin  20.3 
 
 
604 aa  94  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179452 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3626  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  31.79 
 
 
476 aa  93.6  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000133632  normal  0.124331 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2183  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  38.1 
 
 
431 aa  93.6  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000115725 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0885  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.08 
 
 
300 aa  90.9  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0020686  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1194  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.8 
 
 
291 aa  89.4  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00764454  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  36.65 
 
 
236 aa  89  4e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1064  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.16 
 
 
190 aa  87  0.000000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000172144  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  33.33 
 
 
287 aa  87  0.000000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>