105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2561 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  100 
 
 
538 aa  1070    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  66.31 
 
 
551 aa  709    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  62.77 
 
 
540 aa  586  1e-166  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  48.21 
 
 
534 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  49.79 
 
 
533 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  48.25 
 
 
528 aa  443  1e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  50.64 
 
 
547 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  49.36 
 
 
554 aa  435  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  49.36 
 
 
494 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  48.33 
 
 
551 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  49.36 
 
 
521 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  49.36 
 
 
521 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  49.36 
 
 
521 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  48.94 
 
 
521 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  47.13 
 
 
532 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  46.18 
 
 
676 aa  411  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  45.77 
 
 
550 aa  409  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  46.03 
 
 
540 aa  402  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  39.15 
 
 
519 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  39.02 
 
 
519 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  39.18 
 
 
517 aa  390  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  38.99 
 
 
519 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  45.79 
 
 
538 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  38.79 
 
 
519 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  38.79 
 
 
519 aa  386  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  39.24 
 
 
519 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  38.99 
 
 
519 aa  386  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  38.95 
 
 
519 aa  383  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  38.16 
 
 
519 aa  385  1e-105  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  44.21 
 
 
520 aa  385  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  42.18 
 
 
717 aa  380  1e-104  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  43.89 
 
 
406 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  40.91 
 
 
509 aa  362  1e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  44.78 
 
 
437 aa  352  8e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  38.25 
 
 
570 aa  344  2.9999999999999997e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  41.6 
 
 
997 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  40.24 
 
 
519 aa  334  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4809  hypothetical protein  38.72 
 
 
493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  35.84 
 
 
508 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  39.84 
 
 
523 aa  323  3e-87  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  36.87 
 
 
729 aa  323  5e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  42.09 
 
 
393 aa  310  5e-83  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  43.16 
 
 
393 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  43.25 
 
 
442 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  42.36 
 
 
393 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  36.7 
 
 
512 aa  304  3.0000000000000004e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  39.31 
 
 
427 aa  303  4.0000000000000003e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  39.31 
 
 
427 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  39.31 
 
 
427 aa  303  6.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  41.19 
 
 
669 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  39.91 
 
 
447 aa  300  4e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  41.99 
 
 
435 aa  299  8e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  37.21 
 
 
521 aa  299  9e-80  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  38.5 
 
 
431 aa  297  3e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  37.29 
 
 
439 aa  294  2e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  41.35 
 
 
431 aa  295  2e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  37.29 
 
 
439 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  37.29 
 
 
439 aa  294  3e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  37.29 
 
 
439 aa  294  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  37.29 
 
 
439 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  41.08 
 
 
409 aa  293  6e-78  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  37.05 
 
 
439 aa  293  6e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  37.99 
 
 
404 aa  292  1e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  38.7 
 
 
384 aa  290  3e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  37.75 
 
 
404 aa  291  3e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  39.43 
 
 
451 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  37.04 
 
 
431 aa  280  7e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  41.36 
 
 
378 aa  272  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  38.27 
 
 
486 aa  264  3e-69  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  38.95 
 
 
508 aa  260  4e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  32.44 
 
 
481 aa  231  2e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  33.86 
 
 
490 aa  228  2e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2775  protein of unknown function DUF187  28.65 
 
 
605 aa  218  2.9999999999999998e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000508646  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  29.28 
 
 
515 aa  204  3e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  29.91 
 
 
911 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  22.71 
 
 
906 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  23.64 
 
 
1099 aa  83.2  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  27.23 
 
 
906 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  25.66 
 
 
383 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  27.23 
 
 
906 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  26.51 
 
 
535 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  26.49 
 
 
535 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  23.51 
 
 
395 aa  78.2  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  25.59 
 
 
406 aa  78.6  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  23.55 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  24.32 
 
 
416 aa  70.5  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  24.42 
 
 
536 aa  69.7  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  23.02 
 
 
437 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  22.58 
 
 
395 aa  69.3  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  25.2 
 
 
345 aa  67.4  0.0000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  21.4 
 
 
760 aa  66.6  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  23.1 
 
 
420 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2650  hypothetical protein  22.22 
 
 
441 aa  62  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.517664  normal  0.489073 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  23.45 
 
 
380 aa  61.2  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  23.15 
 
 
427 aa  60.1  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  22.37 
 
 
430 aa  59.3  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  21.54 
 
 
427 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4471  protein of unknown function DUF187  23.36 
 
 
357 aa  53.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  27.16 
 
 
806 aa  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  23.08 
 
 
410 aa  52  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>