67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2117 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2117  protein of unknown function DUF187  100 
 
 
806 aa  1610    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0730037  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  28.53 
 
 
906 aa  140  7.999999999999999e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  28.41 
 
 
1099 aa  138  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  26.98 
 
 
906 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  26.92 
 
 
911 aa  129  3e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  26.69 
 
 
906 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2793  hypothetical protein  29.89 
 
 
322 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  25.43 
 
 
395 aa  84.7  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  23.32 
 
 
760 aa  80.1  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  24.92 
 
 
345 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  23.9 
 
 
395 aa  75.1  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  23.95 
 
 
380 aa  72  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  23.9 
 
 
430 aa  70.9  0.0000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  24.15 
 
 
437 aa  70.5  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  23.75 
 
 
535 aa  68.2  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0564  hypothetical protein  23.8 
 
 
361 aa  68.2  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  22.95 
 
 
406 aa  67.4  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  24.3 
 
 
535 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  25.17 
 
 
430 aa  66.6  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  21.99 
 
 
416 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4471  protein of unknown function DUF187  22.14 
 
 
357 aa  62  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  23.32 
 
 
481 aa  61.6  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  27.45 
 
 
536 aa  60.5  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  20.13 
 
 
427 aa  60.1  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  25.2 
 
 
515 aa  58.9  0.0000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  22.66 
 
 
442 aa  58.5  0.0000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  28.96 
 
 
534 aa  55.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  22.22 
 
 
420 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  23.08 
 
 
997 aa  55.5  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  26.78 
 
 
729 aa  54.7  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  26.11 
 
 
437 aa  54.7  0.000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  24.26 
 
 
427 aa  54.3  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  24.26 
 
 
427 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  24.26 
 
 
427 aa  53.9  0.00001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  19.4 
 
 
427 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  22.34 
 
 
431 aa  52.8  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  27.51 
 
 
554 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  23.9 
 
 
508 aa  52.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  27 
 
 
521 aa  53.1  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  27 
 
 
521 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  27 
 
 
521 aa  53.1  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  22.89 
 
 
406 aa  53.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  26.14 
 
 
551 aa  52.8  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  26.25 
 
 
717 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  22.73 
 
 
383 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  22.34 
 
 
409 aa  52.4  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  28.27 
 
 
508 aa  52.4  0.00004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  27.78 
 
 
538 aa  51.6  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  26.62 
 
 
494 aa  50.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  25.07 
 
 
551 aa  50.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  22.46 
 
 
378 aa  48.9  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  26.24 
 
 
521 aa  49.3  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1609  hypothetical protein  20.92 
 
 
390 aa  49.3  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0289476 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2036  hypothetical protein  20.89 
 
 
360 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  24.55 
 
 
431 aa  47.8  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  24.1 
 
 
431 aa  47.8  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  24.05 
 
 
523 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  25.39 
 
 
528 aa  47.4  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  24.27 
 
 
447 aa  47  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  25.61 
 
 
435 aa  46.2  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  23.75 
 
 
519 aa  45.4  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5556  hypothetical protein  24.02 
 
 
704 aa  45.4  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204862  normal  0.0475652 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  21.86 
 
 
550 aa  44.7  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  23.12 
 
 
519 aa  44.7  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  23.1 
 
 
393 aa  44.3  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  23.72 
 
 
540 aa  44.3  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1741  hypothetical protein  26.2 
 
 
508 aa  44.3  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.230988  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>