106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2076 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_2076  hypothetical protein  100 
 
 
528 aa  1066    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.76046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6128  FenI protein  64.19 
 
 
533 aa  669    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0784566  normal  0.824593 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3506  protein of unknown function DUF187  49.9 
 
 
547 aa  473  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.339986  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1956  protein of unknown function DUF187  49.27 
 
 
534 aa  468  9.999999999999999e-131  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0273789  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2396  protein of unknown function DUF187  47.08 
 
 
532 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  unclonable  0.00000000122661  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1414  FenI protein  50.42 
 
 
540 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.0039371  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2393  fenI protein  48.75 
 
 
551 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1156  fenI protein  48.03 
 
 
554 aa  442  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.466056  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1973  putative lipoprotein  48.24 
 
 
521 aa  442  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4428  protein of unknown function DUF187  48.18 
 
 
540 aa  445  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.998711  normal  0.0596861 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2118  fenI protein  48.03 
 
 
494 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.115313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1597  fenI protein  48.03 
 
 
521 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0010634  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0258  fenI protein  48.03 
 
 
521 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1956  putative lipoprotein  47.83 
 
 
521 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0388068  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5534  hypothetical protein  49.04 
 
 
676 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.174721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5682  FenI protein  47.07 
 
 
520 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.663135  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6227  hypothetical protein  46.31 
 
 
550 aa  440  9.999999999999999e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0818  hypothetical protein  42.89 
 
 
717 aa  436  1e-121  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1788  hypothetical protein  43.46 
 
 
517 aa  437  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2416  hypothetical protein  41.63 
 
 
519 aa  435  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1159  protein of unknown function DUF187  44.09 
 
 
551 aa  432  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2494  hypothetical protein  42.24 
 
 
519 aa  431  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2268  hypothetical protein  41.32 
 
 
519 aa  431  1e-119  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159912  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2252  hypothetical protein  41.25 
 
 
519 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2561  protein of unknown function DUF187  48.25 
 
 
538 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.443654  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2557  hypothetical protein  41.61 
 
 
519 aa  428  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.190128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2289  hypothetical protein  41.25 
 
 
519 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.461855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2210  hypothetical protein  41.04 
 
 
519 aa  425  1e-117  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0607732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2914  hypothetical protein  40.99 
 
 
519 aa  425  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.737021 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2477  hypothetical protein  41.25 
 
 
519 aa  424  1e-117  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1770  protein of unknown function DUF187  44.84 
 
 
538 aa  412  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0723  protein of unknown function DUF187  44.07 
 
 
509 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.00880657 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5345  protein of unknown function DUF187  41.61 
 
 
570 aa  383  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3734  protein of unknown function DUF187  41.81 
 
 
508 aa  369  1e-101  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.459123  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1195  protein of unknown function DUF187  40.89 
 
 
406 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2122  hypothetical protein  43.16 
 
 
523 aa  349  8e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4145  protein of unknown function DUF187  39.68 
 
 
519 aa  345  8.999999999999999e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.227733 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0922  protein of unknown function DUF187  39.29 
 
 
437 aa  343  4e-93  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  39.07 
 
 
729 aa  332  8e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2221  protein of unknown function DUF187  43.17 
 
 
997 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.155376  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0061  yngK protein  38.14 
 
 
512 aa  327  4.0000000000000003e-88  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4809  hypothetical protein  37.74 
 
 
493 aa  321  1.9999999999999998e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01950  hypothetical protein  43.67 
 
 
447 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2030  hypothetical protein  45.86 
 
 
435 aa  320  3.9999999999999996e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.14787 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0259  hypothetical protein  39.75 
 
 
669 aa  319  9e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.27195  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2822  hypothetical protein  38.59 
 
 
521 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.980488 
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0031  hypothetical protein  43.17 
 
 
393 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.110752  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2156  protein of unknown function DUF187  44.69 
 
 
439 aa  312  1e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.360071  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1576  putative lipoprotein  44.69 
 
 
439 aa  311  1e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1680  putative lipoprotein  44.69 
 
 
439 aa  311  1e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1822  hypothetical protein  42.06 
 
 
442 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0539291  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1754  putative lipoprotein  44.41 
 
 
439 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.63355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2104  putative lipoprotein  44.69 
 
 
404 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.50348 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01449  predicted liprotein  44.41 
 
 
439 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01462  hypothetical protein  44.41 
 
 
439 aa  310  4e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2166  hypothetical protein  44.69 
 
 
384 aa  310  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.126778  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1682  putative lipoprotein  44.41 
 
 
404 aa  310  5e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1798  putative lipoprotein  43.01 
 
 
427 aa  308  2.0000000000000002e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0730367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0753  hypothetical protein  42.35 
 
 
393 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1472  putative lipoprotein  42.74 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1577  hypothetical protein  42.74 
 
 
427 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2061  hypothetical protein  46.87 
 
 
431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00233563  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1354  hypothetical protein  44.35 
 
 
431 aa  303  5.000000000000001e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.14222  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1310  hypothetical protein  44.09 
 
 
409 aa  301  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1451  hypothetical protein  40.71 
 
 
393 aa  298  1e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00978092  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2356  protein of unknown function DUF187  42.12 
 
 
431 aa  297  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.592468  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03377  YngK protein  44.48 
 
 
378 aa  290  5.0000000000000004e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0802  hypothetical protein  43.47 
 
 
451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4123  protein of unknown function DUF187  34.82 
 
 
481 aa  273  5.000000000000001e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.543211  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1349  protein of unknown function DUF187  36.66 
 
 
508 aa  269  8e-71  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1593  protein of unknown function DUF187  40.11 
 
 
486 aa  261  2e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2257  hypothetical protein  35.56 
 
 
490 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2775  protein of unknown function DUF187  27.93 
 
 
605 aa  219  6e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000508646  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0476  yngK protein  33.25 
 
 
515 aa  208  2e-52  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0631  hypothetical protein  24.12 
 
 
906 aa  104  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.835872 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0321  protein of unknown function DUF187  29.44 
 
 
911 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.140793 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3463  hypothetical protein  23.38 
 
 
1099 aa  82  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.639127  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1581  protein of unknown function DUF187  28.71 
 
 
406 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.088417 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3629  protein of unknown function DUF187  24.55 
 
 
906 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0133  hypothetical protein  26.14 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288293  normal  0.118371 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2542  protein of unknown function DUF187  25.95 
 
 
535 aa  78.2  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3564  protein of unknown function DUF187  26.09 
 
 
535 aa  77.4  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.463453  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1033  protein of unknown function DUF187  23.31 
 
 
395 aa  77.4  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.419258  normal  0.471208 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2484  protein of unknown function DUF187  24.19 
 
 
906 aa  77  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.979378 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1072  hypothetical protein  25.59 
 
 
416 aa  75.1  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0972168 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3137  hypothetical protein  25 
 
 
430 aa  73.6  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.153295  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3619  protein of unknown function DUF187  24.76 
 
 
437 aa  71.2  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1537  protein of unknown function DUF187  25.08 
 
 
380 aa  70.1  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2522  hypothetical protein  24.78 
 
 
420 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.233662 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4403  protein of unknown function DUF187  25.97 
 
 
383 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.137227  normal  0.600099 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1769  hypothetical protein  24.75 
 
 
760 aa  68.2  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7019  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2134  hypothetical protein  24.31 
 
 
536 aa  63.2  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09991  hypothetical protein  27.57 
 
 
410 aa  63.2  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.573849 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3586  hypothetical protein  23.29 
 
 
430 aa  62.4  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.169957  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0336  hypothetical protein  24.75 
 
 
345 aa  61.6  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.329121  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1911  protein of unknown function DUF187  22.36 
 
 
427 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4471  protein of unknown function DUF187  24.53 
 
 
357 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1934  protein of unknown function DUF187  22.47 
 
 
427 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1609  hypothetical protein  22.97 
 
 
390 aa  51.6  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0289476 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1370  hypothetical protein  23.47 
 
 
384 aa  51.2  0.00005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.837101  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>