299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0298 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0422  cell wall/surface repeat protein  41.15 
 
 
1729 aa  670    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00920532  hitchhiker  0.0000607429 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0298  hypothetical protein  100 
 
 
1457 aa  2978    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00924887  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3240  protein of unknown function DUF291  43.88 
 
 
2073 aa  347  7e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3019  S-layer domain protein  43.71 
 
 
609 aa  347  1e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3247  sugar-binding domain protein  39.83 
 
 
2375 aa  328  5e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1547  S-layer domain protein  41.52 
 
 
3320 aa  311  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2434  cell wall/surface repeat protein  34.1 
 
 
2207 aa  224  9e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1307  cellulosome anchoring protein, cohesin region  31.41 
 
 
631 aa  195  6e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  29.55 
 
 
6885 aa  171  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0993  Carbohydrate-binding family 9  29.95 
 
 
2286 aa  161  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.938361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0608  S-layer domain protein  30.19 
 
 
547 aa  152  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.453799  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2489  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  38.58 
 
 
1661 aa  123  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0293  hypothetical protein  27.92 
 
 
1260 aa  119  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00245165  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1781  alpha amylase, catalytic region  26.9 
 
 
1847 aa  117  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.238609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0189  hypothetical protein  29.5 
 
 
548 aa  115  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3099  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.64 
 
 
1016 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0188  hypothetical protein  29.69 
 
 
756 aa  114  1.0000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2319  glycoside hydrolase family 10  32.09 
 
 
1495 aa  107  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3091  Ig family protein  32.82 
 
 
618 aa  103  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  33.7 
 
 
1042 aa  101  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0054  hypothetical protein  31.67 
 
 
729 aa  91.7  9e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000080624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0792  cell wall hydrolase/autolysin  28.21 
 
 
530 aa  91.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000364595  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2999  S-layer domain-containing protein  25.72 
 
 
524 aa  91.3  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0514  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.44 
 
 
1029 aa  89.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0779  S-layer domain-containing protein  26.56 
 
 
693 aa  88.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.725533  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1718  S-layer region-like  29.73 
 
 
414 aa  87.8  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1938  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.89 
 
 
414 aa  87.8  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000112204  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1889  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.89 
 
 
414 aa  87.4  0.000000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000270589  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2644  cell wall/surface repeat protein  30 
 
 
2178 aa  86.7  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.615501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2341  hypothetical protein  30.1 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.920789 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0428  glycoside hydrolase family 5  31.89 
 
 
930 aa  85.9  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1459  Ig-like, group 2  25.45 
 
 
932 aa  85.5  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1714  S-layer domain-containing protein  26.05 
 
 
573 aa  85.9  0.000000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1368  S-layer-like domain-containing protein  31.07 
 
 
710 aa  85.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000486639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1594  5'-nucleotidase/2' 3'-cyclic phosphodiesterase and related esterases-like protein  28.57 
 
 
733 aa  84.7  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0940  S-layer protein  29.07 
 
 
535 aa  84.3  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000994264  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3498  S-layer domain protein  25.08 
 
 
457 aa  84.7  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4391  S-layer protein  29.07 
 
 
535 aa  84.3  0.00000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000169647  unclonable  1.31184e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3478  S-layer domain protein  27.3 
 
 
548 aa  83.2  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1576  cell wall hydrolase/autolysin  29.23 
 
 
410 aa  83.6  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000010106  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1682  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.31 
 
 
414 aa  83.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000845994  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  29.31 
 
 
414 aa  83.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.72375e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1817  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.31 
 
 
414 aa  83.2  0.00000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000725042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1628  S-layer protein and N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase fusion protein  29.31 
 
 
413 aa  82.4  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000159428  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.51 
 
 
1054 aa  82  0.00000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2351  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.81 
 
 
410 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000872091  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2310  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.81 
 
 
410 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.2191900000000004e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2268  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.81 
 
 
410 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000138501  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2528  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.81 
 
 
410 aa  81.3  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000564272  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0789  S-layer protein sap precursor  28.74 
 
 
814 aa  80.1  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0200088  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2320  glycoside hydrolase family 10  32.43 
 
 
1050 aa  80.1  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4955  S-layer domain protein  30.29 
 
 
914 aa  79.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0789  S-layer protein  31.69 
 
 
880 aa  79.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.229168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3495  S-layer domain protein  26.54 
 
 
935 aa  79.7  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0139036  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1376  S-layer domain protein  29.28 
 
 
594 aa  79.7  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000547431  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0841  S-layer protein Sap  28.74 
 
 
814 aa  79.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0822684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0885  s-layer protein sap  28.74 
 
 
814 aa  79.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0796  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.78 
 
 
540 aa  79.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.06495e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1963  S-layer domain protein  28.72 
 
 
1009 aa  79  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000481253  normal  0.0221131 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3962  putative internalin  29.51 
 
 
760 aa  79  0.0000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.769038  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0724  cell wall hydrolase/autolysin  29.21 
 
 
527 aa  78.6  0.0000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000386208  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2837  S-layer protein  28.21 
 
 
472 aa  78.6  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0122747  hitchhiker  0.0000000116253 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2543  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  30.23 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.7515e-61 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0790  S-layer protein, EA1 protein  27.59 
 
 
861 aa  77.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0118731  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1382  putative internalin  29.51 
 
 
760 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2476  S-layer protein  28.49 
 
 
472 aa  77.4  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.612094  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0984  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.38 
 
 
529 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000810888  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1075  S-layer-like domain-containing protein  30.65 
 
 
376 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1079  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.38 
 
 
529 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000334554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0714  Ig domain-containing protein  27.59 
 
 
807 aa  76.6  0.000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000270996  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  28.36 
 
 
1226 aa  76.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3789  cell wall hydrolase/autolysin  29.28 
 
 
538 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0986  surface-layer N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.38 
 
 
529 aa  76.3  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.46837e-61 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3489  S-layer domain protein  29.05 
 
 
506 aa  76.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.662384  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2681  S-layer domain protein  29.19 
 
 
1208 aa  75.9  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0851  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.38 
 
 
529 aa  75.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000657012  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1064  crystal protein  27.59 
 
 
822 aa  75.9  0.000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000577462  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0898  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.38 
 
 
529 aa  75.9  0.000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000140449  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  30.41 
 
 
1321 aa  75.5  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  28.25 
 
 
921 aa  75.5  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0317  hypothetical protein  25.68 
 
 
820 aa  75.1  0.000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0705809  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0079  surface layer protein  31.41 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  2.3790999999999998e-28  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4972  S-layer-like domain-containing protein  29.14 
 
 
939 aa  74.7  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1967  hypothetical protein  23.97 
 
 
1194 aa  74.7  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1687  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, family 3  28.21 
 
 
410 aa  75.1  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000543314  hitchhiker  0.00000000000000117907 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1149  S-layer domain protein  30.11 
 
 
376 aa  74.3  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0842  S-layer protein EA1  25.86 
 
 
862 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00698001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0725  cell wall hydrolase/autolysin  27.53 
 
 
520 aa  74.3  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00509624  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  28.34 
 
 
779 aa  74.3  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0800  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.81 
 
 
529 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000328713  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0887  s-layer protein ea1  25.86 
 
 
862 aa  73.9  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000735579  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0243  hypothetical protein  22.87 
 
 
685 aa  73.6  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1991  hypothetical protein  29.38 
 
 
625 aa  72.8  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.897372  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0643  glycoside hydrolase family 18  29.32 
 
 
542 aa  73.2  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.649155  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0559  S-layer domain protein  23.92 
 
 
1168 aa  72.4  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1065  S-layer protein EA1  25.86 
 
 
859 aa  72.4  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000432724  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2357  S-layer domain-containing protein  29.58 
 
 
1081 aa  72.4  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0251259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0976  GW repeat-containing protein  27.43 
 
 
530 aa  72.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.306565  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3484  Ig domain protein group 2 domain protein  28.89 
 
 
526 aa  72.4  0.00000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0077  S-layer protein  29.35 
 
 
697 aa  72.4  0.00000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0803176  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>