119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3794 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  100 
 
 
1973 aa  3942    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  44.12 
 
 
1201 aa  531  1e-149  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  40.27 
 
 
1363 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  39.87 
 
 
1380 aa  477  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  40.37 
 
 
1363 aa  476  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  40.73 
 
 
1247 aa  458  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  38.74 
 
 
1272 aa  451  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  38.95 
 
 
1303 aa  445  1e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  39.63 
 
 
1248 aa  445  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  38.79 
 
 
1601 aa  442  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  37.39 
 
 
1736 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  36.67 
 
 
1430 aa  436  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  37.44 
 
 
1299 aa  431  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  36.65 
 
 
1299 aa  424  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  34.92 
 
 
1308 aa  252  6e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  33.71 
 
 
734 aa  234  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  35.62 
 
 
480 aa  157  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  25.31 
 
 
1042 aa  152  9e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  26.13 
 
 
779 aa  140  3.0000000000000003e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  25.37 
 
 
625 aa  128  1e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  27.81 
 
 
9585 aa  108  1e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  27.66 
 
 
840 aa  106  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  26.98 
 
 
2068 aa  105  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  33.64 
 
 
841 aa  105  7e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  32.97 
 
 
631 aa  105  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  32.94 
 
 
3507 aa  103  2e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  27.25 
 
 
708 aa  101  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  34.25 
 
 
836 aa  95.9  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  25.93 
 
 
698 aa  93.2  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  26.99 
 
 
4433 aa  91.7  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  27.38 
 
 
620 aa  91.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  26.41 
 
 
647 aa  90.1  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  27.64 
 
 
779 aa  89.7  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  27.01 
 
 
872 aa  87  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  29 
 
 
1094 aa  86.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  27.98 
 
 
647 aa  86.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  28.89 
 
 
779 aa  85.5  0.000000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  23.91 
 
 
798 aa  85.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  28.08 
 
 
661 aa  84.7  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0198  YD repeat-containing protein  29.88 
 
 
3333 aa  83.6  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00448474 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  30.4 
 
 
523 aa  82.8  0.00000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  26.03 
 
 
798 aa  80.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  28.69 
 
 
799 aa  81.6  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  27.53 
 
 
677 aa  80.5  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  30.22 
 
 
670 aa  78.6  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0383  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 
1726 aa  77  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  28.04 
 
 
625 aa  75.1  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  26.47 
 
 
536 aa  75.1  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  33 
 
 
1113 aa  74.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  28.3 
 
 
687 aa  73.9  0.00000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  25 
 
 
861 aa  72  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  27.4 
 
 
706 aa  71.6  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  27.17 
 
 
527 aa  70.1  0.0000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  29.92 
 
 
508 aa  68.9  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  41.98 
 
 
340 aa  68.9  0.0000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  26.32 
 
 
528 aa  67  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  28.08 
 
 
674 aa  66.2  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3723  fibronectin, type III domain-containing protein  24.91 
 
 
2286 aa  65.5  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  26.97 
 
 
1462 aa  65.5  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3673  fibronectin type III domain-containing protein  27.24 
 
 
2170 aa  63.9  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.20402 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3156  Fibronectin type III domain protein  23.66 
 
 
741 aa  63.9  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27230  subtilisin-like serine protease  29.62 
 
 
801 aa  62.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0273209  normal  0.322238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  34 
 
 
676 aa  62.8  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  29.56 
 
 
1628 aa  62  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4482  putative cell wall binding repeat 2-containing protein  27.74 
 
 
795 aa  61.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000203992  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  32.54 
 
 
995 aa  61.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1543  cellulosome anchoring protein cohesin region  30.35 
 
 
782 aa  60.5  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000430269  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0370  Galactose oxidase  28.57 
 
 
918 aa  60.8  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1235  cellulose 1,4-beta-cellobiosidase  25.8 
 
 
6885 aa  59.7  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  30.89 
 
 
999 aa  59.7  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  25.32 
 
 
903 aa  59.7  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  30.8 
 
 
1735 aa  59.3  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2403  PA14 domain protein  30.74 
 
 
1172 aa  58.9  0.0000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  29.41 
 
 
1199 aa  58.5  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2773  Fibronectin type III domain protein  21.96 
 
 
690 aa  58.5  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000670095 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  28.29 
 
 
486 aa  57.4  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  44.44 
 
 
409 aa  57.4  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  24.57 
 
 
515 aa  57.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  42.31 
 
 
536 aa  56.6  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  26.98 
 
 
679 aa  56.2  0.000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2395  glycoside hydrolase family 5  27.07 
 
 
1221 aa  56.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.740563  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  36.78 
 
 
776 aa  56.2  0.000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  31.63 
 
 
673 aa  55.8  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3381  multicopper oxidase type 2  22.8 
 
 
628 aa  55.8  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2630  fibronectin type III domain-containing protein  27.96 
 
 
825 aa  55.5  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4107  hypothetical protein  41.18 
 
 
244 aa  53.9  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  35.71 
 
 
643 aa  53.9  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  37.61 
 
 
566 aa  53.5  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4253  fibronectin type III domain-containing protein  29.86 
 
 
680 aa  53.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2321  Fibronectin type III domain protein  26.69 
 
 
701 aa  53.1  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0275  Bilirubin oxidase  26.09 
 
 
569 aa  52.4  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.140932  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  28.95 
 
 
715 aa  52  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3600  beta-lactamase  35.2 
 
 
584 aa  52.4  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  30.92 
 
 
2334 aa  52  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0610  fibronectin type III domain protein  22.75 
 
 
404 aa  50.8  0.0002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0456  hypothetical protein  22.98 
 
 
1062 aa  49.7  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.97303  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 
580 aa  49.7  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  25.33 
 
 
1377 aa  49.3  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1288  fibronectin type III domain-containing protein  24.13 
 
 
394 aa  49.3  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.125445  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  28.07 
 
 
905 aa  48.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>