37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4308 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1377 aa  2805    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3586  conserved repeat domain protein  26.16 
 
 		 3324 aa  109  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.197095 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0177  conserved repeat domain protein  31.66 
 
 		 5544 aa  75.9  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0400356 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2528  hypothetical protein  25.7 
 
 		 2270 aa  74.7  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0597  hypothetical protein  30.25 
 
 		 1547 aa  68.2  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.881109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  31 
 
 		 1042 aa  65.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  36.14 
 
 		 4071 aa  62  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5096  hypothetical protein  35.43 
 
 		 989 aa  60.5  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4946  hypothetical protein  29 
 
 		 711 aa  60.1  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  33.33 
 
 		 480 aa  59.7  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  50 
 
 		 3507 aa  58.5  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  37.66 
 
 		 527 aa  57  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  37.93 
 
 		 340 aa  56.2  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4090  protein of unknown function DUF303 acetylesterase putative  23.62 
 
 		 1068 aa  55.1  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  36 
 
 		 853 aa  54.7  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  42.31 
 
 		 995 aa  54.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4205  hypothetical protein  24.87 
 
 		 1386 aa  53.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3452  hypothetical protein  25.88 
 
 		 1549 aa  52.8  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0117697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  25.33 
 
 		 1973 aa  52.4  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  38.46 
 
 		 409 aa  51.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  41.77 
 
 		 2334 aa  51.2  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  40 
 
 		 1299 aa  51.2  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  26.53 
 
 		 1363 aa  51.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  32.99 
 
 		 4433 aa  50.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1240  bifunctional xylanase/esterase; CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein and carbohydrate esterase family 4 protein  25.58 
 
 		 1748 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.267391  normal  0.341436 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  32.14 
 
 		 1363 aa  49.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  38.33 
 
 		 1299 aa  49.3  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  37.5 
 
 		 1272 aa  48.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  32.35 
 
 		 478 aa  48.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4115  hypothetical protein  26.91 
 
 		 2278 aa  48.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.143212  hitchhiker  0.000960597 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  40.26 
 
 		 1430 aa  47.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.66 
 
 		 2833 aa  47.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  30.12 
 
 		 752 aa  46.6  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  29.41 
 
 		 1113 aa  46.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  30.91 
 
 		 938 aa  45.8  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  29.79 
 
 		 1380 aa  45.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1162  pectate lyase  28.22 
 
 		 991 aa  45.1  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.211021 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>