26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0459 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  100 
 
 		 478 aa  967    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1521  hypothetical protein  33.69 
 
 		 492 aa  279  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812008  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  36.21 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  46.15 
 
 		 1042 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  44.44 
 
 		 527 aa  63.5  0.000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  36.11 
 
 		 3507 aa  56.2  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  30.09 
 
 		 995 aa  55.8  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  31.63 
 
 		 480 aa  55.5  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  32.47 
 
 		 861 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5064  conserved repeat domain protein  32.5 
 
 		 853 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  30.77 
 
 		 409 aa  48.9  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 999 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  32.35 
 
 		 1377 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  41.89 
 
 		 14944 aa  48.1  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2757  fibronectin, type III  37.88 
 
 		 490 aa  47.4  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.48041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  34.92 
 
 		 2068 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  29.31 
 
 		 4433 aa  47.4  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  31.82 
 
 		 779 aa  47.4  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1684  serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 		 673 aa  47.4  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2491  Fibronectin type III domain protein  32.26 
 
 		 566 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  32.84 
 
 		 1113 aa  44.7  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  35.29 
 
 		 1363 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.94 
 
 		 670 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  34.15 
 
 		 1363 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  32.26 
 
 		 2334 aa  43.9  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  33.33 
 
 		 1380 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>