13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1521 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1521  hypothetical protein  100 
 
 		 492 aa  997    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.812008  normal  0.0835787 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0459  hypothetical protein  33.69 
 
 		 478 aa  279  8e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0813872  normal  0.0506125 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  40.28 
 
 		 340 aa  58.5  0.0000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  32.94 
 
 		 3507 aa  57.4  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  45.76 
 
 		 527 aa  54.3  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  34.21 
 
 		 1042 aa  50.1  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  33.71 
 
 		 480 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  37.33 
 
 		 779 aa  47.8  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  40.82 
 
 		 2068 aa  47  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2628  fibronectin, type III domain-containing protein  38.71 
 
 		 999 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.627323  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  29.55 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  38.33 
 
 		 1113 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  30.26 
 
 		 4433 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>