79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1394 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1394  spore coat protein-related protein  46.58 
 
 		 1303 aa  893    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.617881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3108  multicopper oxidase type 2  49.18 
 
 		 1430 aa  985    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00507653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1360  fibronectin type III domain-containing protein  41.66 
 
 		 1247 aa  709    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.858944  decreased coverage  0.000129137 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1402  fibronectin, type III domain-containing protein  40.38 
 
 		 1248 aa  692    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.215037 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1486  multicopper oxidase type 2  44.93 
 
 		 1601 aa  853    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.131565  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  44.95 
 
 		 1363 aa  949    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  46.1 
 
 		 1299 aa  880    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2066  multicopper oxidase type 2  48.05 
 
 		 1736 aa  895    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.697525  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 1272 aa  2573    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  44.8 
 
 		 1363 aa  946    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  46.11 
 
 		 1380 aa  944    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0071  multicopper oxidase type 2  46.52 
 
 		 1299 aa  891    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.3532599999999997e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2163  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  49.12 
 
 		 1201 aa  754    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120195 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  38.87 
 
 		 1973 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3048  multicopper oxidase, type 2  50.56 
 
 		 1308 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2583  twin-arginine translocation pathway signal  32.7 
 
 		 734 aa  329  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.574228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2155  multicopper oxidase, type 2  27.1 
 
 		 708 aa  121  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00869514  normal  0.117402 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4294  Bilirubin oxidase  34.04 
 
 		 625 aa  120  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3440  multicopper oxidase type 2  24.37 
 
 		 799 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.912192  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1946  multicopper oxidase type 2  29.46 
 
 		 661 aa  112  5e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2248  multicopper oxidase, type 2  23.88 
 
 		 872 aa  110  2e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3299  multicopper oxidase, type 2  24.65 
 
 		 798 aa  110  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2165  Integrins alpha chain:multicopper oxidase, type 2  28.37 
 
 		 1094 aa  109  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000701868 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4099  multicopper oxidase type 2  25.6 
 
 		 779 aa  108  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3376  multicopper oxidase type 2  25.61 
 
 		 798 aa  107  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.407133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1405  Bilirubin oxidase  26.32 
 
 		 677 aa  104  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104359 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2657  spore coat protein A  28.18 
 
 		 840 aa  103  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4007  multicopper oxidase type 2  24.6 
 
 		 779 aa  102  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.916825  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4819  Bilirubin oxidase  33.58 
 
 		 625 aa  102  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  36 
 
 		 480 aa  100  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3891  Bilirubin oxidase  32.06 
 
 		 698 aa  99  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.362142  normal  0.172229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1607  multicopper oxidase, type 2  25.63 
 
 		 687 aa  99.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.121138  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1652  bilirubin oxidase  30.66 
 
 		 631 aa  96.3  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.089114  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2259  multicopper oxidase type 2  37.44 
 
 		 620 aa  95.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000216941 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1049  multicopper oxidase type 2  31.62 
 
 		 523 aa  89.7  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.541627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2658  Bilirubin oxidase  31.66 
 
 		 676 aa  85.5  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.42805  normal  0.0908171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0501  Bilirubin oxidase  33.96 
 
 		 647 aa  85.1  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111584  normal  0.879523 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1072  hypothetical protein  30.77 
 
 		 706 aa  83.6  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2680  Bilirubin oxidase  35.03 
 
 		 647 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  38.19 
 
 		 3507 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1103  hypothetical protein  46.48 
 
 		 76 aa  69.3  0.0000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0650197  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  26.34 
 
 		 779 aa  66.2  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  49.4 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0532  Bilirubin oxidase  34.81 
 
 		 536 aa  63.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  28.25 
 
 		 4433 aa  63.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  26.53 
 
 		 1042 aa  63.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3668  fibronectin type III domain-containing protein  29.95 
 
 		 836 aa  59.3  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  27.27 
 
 		 2334 aa  57.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.205023 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1683  serine/threonine protein kinase  38.75 
 
 		 776 aa  57.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1569  helix-turn-helix, AraC type  33.67 
 
 		 1113 aa  57.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1241  multicopper oxidase type 2  31.33 
 
 		 643 aa  58.2  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.584214  hitchhiker  0.00926159 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  32.31 
 
 		 715 aa  56.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0156  Bilirubin oxidase  29.3 
 
 		 528 aa  55.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4816  Bilirubin oxidase  28.28 
 
 		 512 aa  55.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.237697  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  31.82 
 
 		 448 aa  55.5  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  44.16 
 
 		 861 aa  54.3  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0432  Fibronectin type III domain protein  39.02 
 
 		 340 aa  53.1  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3289  PKD repeat-containing protein  34.09 
 
 		 995 aa  53.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.745526  hitchhiker  0.000000829414 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0431  Bilirubin oxidase  25.65 
 
 		 527 aa  52.8  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4207  Bilirubin oxidase  33.06 
 
 		 508 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.954402  hitchhiker  0.00146599 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4005  Bilirubin oxidase  25.93 
 
 		 505 aa  50.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  34.85 
 
 		 14944 aa  51.2  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0818  Bilirubin oxidase  27.81 
 
 		 487 aa  50.8  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2202  fibronectin type III domain-containing protein  27.81 
 
 		 841 aa  50.4  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.536559 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4297  Bilirubin oxidase  28.89 
 
 		 877 aa  49.7  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2898  Bilirubin oxidase  26.94 
 
 		 506 aa  48.9  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4308  Fibronectin type III domain protein  37.5 
 
 		 1377 aa  48.5  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0936224  hitchhiker  0.00620072 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2394  Fibronectin type III domain protein  34.29 
 
 		 580 aa  48.5  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.374405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  34.25 
 
 		 670 aa  47.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1113  Bilirubin oxidase  34.02 
 
 		 679 aa  47  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0773118  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2863  Bilirubin oxidase  31.18 
 
 		 536 aa  47  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1438  cell division protein SufI  24.34 
 
 		 486 aa  46.6  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.458618 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0948  multicopper oxidase type 3  26.2 
 
 		 490 aa  46.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000126918 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4659  Bilirubin oxidase  27.78 
 
 		 515 aa  45.8  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.010266  hitchhiker  0.00471634 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4880  Bilirubin oxidase  26.21 
 
 		 502 aa  45.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.297239 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2591  multicopper oxidase type 2  28 
 
 		 895 aa  45.1  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0400357 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2270  Bilirubin oxidase  26.21 
 
 		 502 aa  45.1  0.008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.432018  normal  0.115126 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31267  predicted protein  40.45 
 
 		 965 aa  45.1  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.533629  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4257  repressor protein for FtsI  31.34 
 
 		 471 aa  45.1  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391434 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>