23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4107 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4107  hypothetical protein  100 
 
 		 244 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1573  major tail protein, putative  88.52 
 
 		 244 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0039923 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0777  hypothetical protein  64.04 
 
 		 164 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08210  hypothetical protein  64.04 
 
 		 164 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.360932  hitchhiker  0.0000533826 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1345  hypothetical protein  57.89 
 
 		 165 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.285465 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2956  prophage LambdaSo, major tail protein V, putative  35.45 
 
 		 157 aa  79.7  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2586  prophage LambdaSo, major tail protein V, putative  34.55 
 
 		 157 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.730482 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  44.44 
 
 		 603 aa  70.1  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2752  hypothetical protein  39.52 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3758  hypothetical protein  42 
 
 		 1074 aa  57.4  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.207079  normal  0.135364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  47.62 
 
 		 1973 aa  55.8  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3600  beta-lactamase  47.89 
 
 		 584 aa  55.1  0.000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0747  hypothetical protein  46.88 
 
 		 474 aa  53.9  0.000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.346029  normal  0.109528 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2527  parallel beta-helix repeat-containing protein  50.65 
 
 		 847 aa  52.8  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2690  secreted hydrolase-like protein  50.82 
 
 		 442 aa  52  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.444821  normal  0.694304 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3959  hypothetical protein  54.67 
 
 		 1066 aa  50.4  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.383952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2137  hypothetical protein  37.62 
 
 		 308 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.534217  normal  0.49056 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3389  hypothetical protein  32.2 
 
 		 310 aa  47.8  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000807621 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2295  phage tail sheath protein  39.24 
 
 		 476 aa  46.6  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0957  RagB/SusD domain protein  35.37 
 
 		 626 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.220782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  41.13 
 
 		 613 aa  45.4  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3326  phage tail sheath protein  37.88 
 
 		 478 aa  43.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833077  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0241  hypothetical protein  43.93 
 
 		 810 aa  42.7  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>