31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3111 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3111  peptidase M12B, ADAM/reprolysin  100 
 
 
715 aa  1467    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.894939  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0574  fibronectin, type III domain-containing protein  32.26 
 
 
4433 aa  76.3  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0431  Pectate lyase/Amb allergen  29.89 
 
 
527 aa  62.8  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.471187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2469  fibronectin, type III  31.11 
 
 
3507 aa  62  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0912  fibronectin, type III/multicopper oxidase, type 2  29.77 
 
 
1380 aa  61.2  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0965  Fibronectin type III domain protein  29.31 
 
 
1363 aa  58.9  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0264  Fibronectin type III domain protein  30.98 
 
 
480 aa  57.4  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.375315  normal  0.632573 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00310  conserved hypothetical protein  24.89 
 
 
912 aa  57  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05619  ADAM family of metalloprotease ADM-B (AFU_orthologue; AFUA_4G11150)  24.12 
 
 
825 aa  57  0.000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00103668  normal  0.0270477 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0962  Fibronectin type III domain protein  29.94 
 
 
1363 aa  55.1  0.000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0274  S-layer domain protein  26.75 
 
 
779 aa  55.1  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.430281  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1101  Fibronectin type III domain protein  34.16 
 
 
1462 aa  53.9  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0957  PA14 domain protein  33.04 
 
 
3802 aa  53.5  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.168147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  33.91 
 
 
1735 aa  53.9  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  31.96 
 
 
1199 aa  53.1  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2036  fibronectin, type III domain-containing protein  31.32 
 
 
2068 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.573808  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2535  hypothetical protein  28.19 
 
 
670 aa  51.6  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406731  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  28.51 
 
 
1628 aa  50.8  0.00008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3794  fibronectin type III domain-containing protein  29.41 
 
 
1973 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03040  zinc metalloprotease precursor, putative  22.57 
 
 
614 aa  50.4  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.195421  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2454  fibronectin, type III  26.71 
 
 
1042 aa  49.3  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1493  cellulose-binding domain-containing protein  33.91 
 
 
1055 aa  48.9  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.498527  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0088  multicopper oxidase type 2  27.11 
 
 
1299 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516794  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  36.63 
 
 
2927 aa  47  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1712  hypothetical protein  39.18 
 
 
422 aa  46.2  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.657761  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0740  fibronectin, type III domain-containing protein  36.54 
 
 
409 aa  45.8  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128234  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1503  ATPase  31.65 
 
 
674 aa  45.4  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000259399  hitchhiker  0.000359173 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02810  ADAM family of metalloprotease ADM-A (AFU_orthologue; AFUA_6G14420)  22.36 
 
 
722 aa  45.1  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1314  Fibronectin type III domain protein  39.24 
 
 
211 aa  44.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000146829  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1394  Fibronectin type III domain protein  35.16 
 
 
1272 aa  44.3  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.905341 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3704  PA14 domain protein  36.05 
 
 
2334 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.205023 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>